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期刊文章详细信息

PEG模拟干旱胁迫下野生大豆转录组分析    

The Transcriptome Analysis of Wild Soybean Under Drought Stress Simulated by PEG

  

文献类型:期刊文章

作  者:张小芳[1] 王冰冰[1] 徐燕[1] 张炜坤[1] 赵恢[1] 张锴[1] 乔亚科[1] 李桂兰[1]

ZHANG Xiao-fang;WANG Bing-bing;XU Yan;ZHANG Wei-kun;ZHAO Hui;ZHANG Kai;QIAO Ya-ke;LI Gui-lan(College of Agronomy and Biotechnology, Hebei Normal University of Science and Technology, Changli 066600, China)

机构地区:[1]河北科技师范学院农学与生物科技学院,河北昌黎066600

出  处:《大豆科学》

基  金:转基因生物新品种培育科技重大专项(2014ZX0800404B);河北省自然科学基金(C2016407100;C2014407051);河北省研究生创新资助项目(CXZZSS2018148)

年  份:2018

卷  号:37

期  号:5

起止页码:681-689

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2017_2018、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘  要:为研究耐旱型野生大豆在干旱胁迫下基因表达谱的变化,从备选野生大豆材料中筛选抗旱性强的野生大豆品种,同时探讨最适PEG胁迫浓度,而后以野生大豆永46为试验材料,利用RNA-seq技术对20%PEG6000处理不同时间的叶片进行基因表达谱差异分析。结果显示:获得39 183个序列信息,其中各时期共有序列27 875个。随干旱胁迫时间延长,差异表达基因数量发生变化,胁迫12 h达到最多。根据GO功能分析可将序列大致分为分子功能、细胞成分和生物学过程三大类,其差异表达基因广泛涉及糖、脂类、蛋白质和核酸等生物大分子代谢、能量代谢以及次生代谢过程。在KEGG数据库中,依据代谢途径可将其定位在127个分支,包括植物-病原体互作、植物激素信号转导、RNA降解、ABC转运蛋白等,其中植物激素信号转导途径在不同时间处理下的变化都显著。转录因子分析发现在干旱胁迫下变化明显的转录因子家族包括MYB、bHLH、AP2\EREBP、WRKY和NAC等。对4个不同功能基因干旱胁迫后不同时间的表达量进行荧光定量分析,其变化趋势与转录组数据相同。

关 键 词:野生大豆 RNA-SEQ 干旱胁迫 转录组

分 类 号:S565.1]

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