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期刊文章详细信息

小麦RING型E3泛素连接酶基因TaSDIR1-D克隆与功能分析    

Cloning and Functional Analysis of a RING-type E3 Ubiquitin Ligase Gene TaSDIR1-D in Wheat

  

文献类型:期刊文章

作  者:王瑞同[1] 王景一[2] 毛新国[2] 昌小平[2] 刘惠民[1] 景蕊莲[2]

WANG Rui-tong;WANG Jing-yi;MAO Xin-guo;CHANG Xiao-ping;LIU Hui-min;JING Rui-lian(College of Bioengineering,University of Shanxi,Taiyuan 030000;Institute of Crop Sciences,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100081)

机构地区:[1]山西大学生物工程学院,太原030000 [2]中国农业科学院作物科学研究所,北京100081

出  处:《植物遗传资源学报》

基  金:国家自然科学基金(31271720);中国农业科学院科技创新工程协同创新任务(CAAS-XTCX2016019)

年  份:2018

卷  号:19

期  号:5

起止页码:951-958

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2017、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘  要:具有RING结构域的E3泛素连接酶SDIR1(Salt-and drought induced really interesting new gene finger1)在植物信号调节通路中发挥着重要的作用。本研究克隆得到小麦TaSDIR1-D基因,基因组序列全长4070 bp,其中编码区上游为1443 bp,编码区为2352 bp,3'端非编码区(UTR)为275 bp;该基因编码区cDNA序列长度为849 bp,预测其编码282个氨基酸,包括2个跨膜结构域和1个保守的RING型finger结构域。以野生近缘种的二倍体、四倍体和六倍体普通小麦及一套由中国春为背景的缺-四体为材料,将基因定位在染色体4D上;小麦抽穗期TaSDIR1-D在旗叶中的表达量最高;在NaCl、ABA、PEG及4℃非生物胁迫诱导下,小麦TaSDIR1-D均上调表达,可能参与植物抗逆调节通路;通过检测32份多态性较高的小麦材料TaSDIR1-D基因序列多态性,共检测到2个SNP,基因的编码区和上游序列中各存在1个核苷酸变异,其中编码区的核苷酸变异位点(G/A)位于第4外显子上,为非同义突变,使精氨酸(Agr)变为组氨酸(His)。2个SNP组成两种单倍型,根据-583 bp处的SNP(T/C)设计分子标记SNP-583,扫描自然群体262份材料的基因型,将其分为2种单倍型,分别与千粒重、倒二节长和穗长显著相关或极显著相关,单倍型Hap-4D-2为提高千粒重的优异单倍型。研究结果为小麦分子育种提供了理论依据和基因资源。

关 键 词:TaSDIR1-D  RING型E3泛素连接酶  抗逆性 分子标记 关联分析  

分 类 号:S512.1]

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