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期刊文章详细信息

生物信息学分析RIPK4的分子结构与功能    

Bioinformatics analysis of the structure and function of RIPK4

  

文献类型:期刊文章

作  者:刘畅[1,2] 刘安[3]

LIU Chang1,2, LIU An3(1. Central Laboratou, Changzhi Medical College, Changzhi 046000, China; 2. Department of Biochemistry and Molecular Biology, Shanxi Medical University, Taiyuan 030001, China; 3 . Medical Department, Heji Hospital Affiliated to Changzhi Medical College, Changzhi 046000, China)

机构地区:[1]长治医学院中心实验室,山西长治046000 [2]山西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室,太原030001 [3]长治医学院附属和济医院医务科,山西长治046000

出  处:《生物信息学》

年  份:2018

卷  号:16

期  号:2

起止页码:105-112

语  种:中文

收录情况:ZGKJHX、普通刊

摘  要:针对RIPK4(Receptor-interacting serine/threonine kinase protein 4)结构与功能的报道较少且矛盾。本研究使用生物信息学手段,对RIPK4蛋白的理化性质、组织表达、亚细胞定位、信号肽和跨膜区、空间结构、蛋白质相互作用网络及序列同源性进行分析。结果表明人RIPK4蛋白是酸性不稳定的亲水蛋白,无信号肽和跨膜区域,定位于细胞质的可能性最大,主要二级结构为α-螺旋和无规则卷曲,属于PKc_like和ANK超家族。经GO分析和KEGG通路分析可知,与RIPK4相互作用的蛋白PHLPP1、PHLPP2、ACACA、ACACB、CNOT6L和CNOT6值得深入研究,预示RIPK4存在更为复杂的分子功能和作用机制。为进一步研究RIPK4的功能提供一定的参考。

关 键 词:RIPK4  生物信息学 结构  功能  相互作用蛋白

分 类 号:Q71]

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