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基于生物信息学分析SLC19A3基因在乳腺癌中的表达意义及蟾毒灵的干预研究
Expression and clinical significance of SLC19A3 in breast cancer and effects of Bufalin on the expression of SLC19A3: analysis based on the data-mining from bioinformatics
文献类型:期刊文章
LI Dan;YU Tao;LI Jing;ZHANG Fan;ZENG Junfen;PENG Yan(Department of Pharmacy,Rennlin Hospital of Wuhan University,Hubei Province,Wuhan 430060,China;Department of Oneology of Integrated Chinese and Western Medicine,Wuhan Central Hospital Affiliated to Tongji Medical College,Huazhong University of Science and Technology,Hubei Province,Wuhan 430014,China;Teaching and Research Office of Diagnostics of Chinese Medicine,College of Basic Medicine,Hubei University of Chinese Medicine,Hubei Province,Wuhan 430065,China)
机构地区:[1]武汉大学人民医院药学部,湖北武汉430060 [2]华中科技大学同济医学院附属武汉中心医院中西结合肿瘤科,湖北武汉430014 [3]湖北中医药大学基础医学院中医诊断学教研室,湖北武汉430065
基 金:国家自然科学基金资助项目(81704023);湖北省卫计委中西医结合科研一般项目(2017-23)
年 份:2018
卷 号:15
期 号:17
起止页码:12-16
语 种:中文
收录情况:CAS、JST、RCCSE、ZGKJHX、普通刊
摘 要:目的分析可溶性载体SLC19A3基因在乳腺癌中的表达及临床意义,并探讨蟾毒灵(Bufalin)对乳腺癌细胞中SLC19A3基因的干预作用。方法检索Oncomine和GEO数据库中从建库至今有关乳腺癌和Bufalin干预乳腺癌的数据集,对所获取的数据资料进行数据挖掘,分析SLC19A3基因在乳腺癌组织和正常乳腺组织中的表达情况,及其与预后的关系。同时分析Bufalin对乳腺癌细胞中SLC19A3基因表达水平的影响,并结合文献资料综合分析。结果对Oncomine数据库中共收集的9项关于乳腺癌和乳腺正常组织SLC19A3基因有差异表达的研究数据集进行分析,发现乳腺癌组织中SLC19A3基因的表达明显高于乳腺正常组织,差异有统计学意义(P<0.05)。通过生存分析发现低表达SLC19A3基因的乳腺癌患者无病生存期明显短于高表达者,高表达患者的预后更好(P<0.05)。通过挖掘GEO数据库中的数据集GSE85871发现Bufalin能够上调乳腺癌细胞SLC19A3基因的表达(P<0.01)。结论 SLC19A3基因在乳腺癌组织中呈现低表达,并与乳腺癌患者的预后相关,该基因可能是Bufalin干预乳腺癌细胞的一个新靶点。
关 键 词:蟾毒灵 乳腺癌 SLC19A3基因 数据挖掘
分 类 号:R735.2]
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