文献类型：期刊文章

作　　者：孙娜[1] 史传道[1] 张荣强[1] 张帆[1] 李星慧[1] 张章[1]

SUN Na;SHI Chuan-dao;ZHANG Rong-qiang;ZHANG Fan;LI Xing-hui;ZHANG Zhang(Department of Epidemiology and Health Statistics,Shool of Public Health,Shaanxi University of Chinese Medicine,Xianyang 712046,Shanxi,China)

机构地区：[1]陕西中医药大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室,咸阳712046

出　　处：《中华骨质疏松和骨矿盐疾病杂志》

基　　金：国家自然科学基金青年项目(81603420);陕西省科技统筹创新工程计划项目(2012KTCL03-22);陕西省中医药管理局中医药科研课题(13-LC069);陕西中医药大学2014年校内科研基金(14XJZR07)

年　　份：2018

卷　　号：11

期　　号：4

起止页码：369-374

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CSCD、CSCD2017_2018、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的利用基因芯片公共数据库中RNA标本芯片数据,分析绝经后骨密度降低程度不同的骨质疏松症患者外周血基因表达谱及分子网络变化。方法从基因芯片公共数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中下载美国奥马哈20名绝经后妇女的外周血RNA标本基因芯片数据,利用基因云、基因大数据分析(Gene-Cloud of Biotechnology Informs,GCBI)实验平台、Gen Clip2.0、Sytoscape 3.5.1等软件,筛选差异表达基因。结果差异基因主要涉及MAPK调节、细胞内信号转导的调控、细胞运动、免疫效应等生物学功能。基因网络中以MAPK3、ARRB2、STK11、USP9X、MYO1C、GTF2H1等基因degree值较大,基因MAPK3、ARRB2、STK11、MYO1C、GTF2H1在不同骨密度人群中表达差异有统计学意义(P<0.05),其中基因MAPK3、ARRB2、STK11和MYO1C诊断价值有统计学意义(P<0.05)。结论 MAPK3、ARRB2、STK11和MYO1C基因为蛋白网络核心节点。MAKP3和ARRB2基因与骨质疏松的发生关系密切。

关 键 词：骨质疏松 基因表达 生物信息学

分 类 号：R681]