文献类型：期刊文章

作　　者：王华[1] 汪王微[1] 王冬良[1] 张石虎[1] 胡新芳[1] 卢诗雨[1] 龚雪梅[2]

WANG Hua;WANG Wangwei;WANG Dongliang;ZHANG Shihu;HU Xinfang;LU Shiyu;GONG Xuemei(Department of Ornamental Horticulture,School of Horticulture,Anhui Agricultural University,Hefei 230036,China;Department of Biochemical Engineering,Fuyang Institute of Technology,Fuyang 236031,China)

机构地区：[1]安徽农业大学园艺学院观赏园艺系,安徽合肥230036 [2]阜阳职业技术学院生化工程系,安徽阜阳236031

出　　处：《浙江农业学报》

基　　金：安徽省高校自然科学研究项目(KJ2016A237;KJ2016A558)

年　　份：2018

卷　　号：30

期　　号：7

起止页码：1149-1159

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CAB、CSCD、CSCD2017_2018、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：采用2代Illumina Hi-Seq测序技术对2年生杜鹃花白凤4号(Rhododendron pulchurum cv.Bai Feng 4)扦插苗叶片的转录组进行测序,获得了213 723 424条Clean reads数据,经过质控和De novo。组装共获得平均长度为930 nt的53 568个Unigenes。与Nr、Swiss-Prot、KOG、KEGG四大数据库进行BLAST信息比对(Evalue≤10^(-5)),共获得28 877个注释基因。与Nr数据库序列同源性比较发现,杜鹃花与葡萄(Vitis vinifera)具有较高的同源性,而与其他物种的同源性较低。杜鹃花转录组的Unigenes在KOG数据库比对上30 508个注释,分为25类。在GO数据库比对上17 218个Unigenes,其中与抗逆有关的Unigenes有11 928个。在KEGG数据库的132条代谢通路中富集了6 475个杜鹃花Unigenes,其中注释到植物激素生物合成代谢途径和信号转导途径的有384个。同时,有1 062个Unigenes被注释为转录因子,有8 738条SSR标记被挖掘。

关 键 词：杜鹃花 转录组 测序 基因功能注释  

分 类 号：S685.21]