文献类型：期刊文章

作　　者：许瑞瑞[1,2] 李睿[2] 王小非[2] 郝玉金[2]

XU RuiRui;LI Rui;WANG XiaoFei;HAO YuJin(College of Biological and Agricultural Engineering, Weifang University/Key Laboratory of Biochemistry and Molecular Biology in Universities of Shandong, Weifang 261061, Shandong;College of Horticulture Science and Technology, Shandong Agricultural University/National Research Center for Apple Engineering and Technology, Tai ＇an 271018, Shandong)

机构地区：[1]潍坊学院生物与农业工程学院/山东省高校生物化学与分子生物学重点实验室,山东潍坊261061 [2]山东农业大学园艺科学与工程学院/国家苹果工程技术研究中心,山东泰安271018

出　　处：《中国农业科学》

基　　金：国家自然科学基金青年基金(31400225);潍坊市科学技术发展计划(2016GX010)

年　　份：2018

卷　　号：51

期　　号：10

起止页码：1948-1959

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、FSTA、GEOBASE、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：【目的】从苹果全基因组中鉴定OFP(OVATE family protein)家族蛋白成员,对其进行基因结构特征、组织表达及非生物逆境等系统分析,为研究苹果OFP的潜在功能提供理论基础。【方法】利用生物信息学手段,在苹果基因组数据库中筛选鉴定OFP基因家族成员;利用MEGA5.0软件进行系统进化树分析;通过Map Draw和GSDS等生物信息学工具分析基因结构及染色体定位;根据已有的苹果芯片数据库结果进行OFP基因表达谱分析;利用实时荧光定量PCR技术检测13个Md OFP的组织表达和诱导表达情况。【结果】苹果OFP基因家族包含28个成员,根据系统进化关系将其分为4组,分别包含13、6、4和5个成员;苹果中13条染色体上均有OFP基因分布,其中第12条染色体最多,有6个Md OFP成员,该基因家族的分布具有广泛性;芯片表达谱分析结果表明该类基因家族在花、果实和叶中的表达量较高,q RT-PCR验证结果较一致;经Na Cl和PEG处理后,苹果根部与地上部呈现出不同程度的响应差异,Na Cl处理明显诱导两组织中Md OFP04和Md OFP20的表达,Md OFP01、Md OFP12和Md OFP18的表达在根部与地上部组织则相反;温度胁迫明显影响Md OFPs的表达量,其中Md OFP04和Md OFP17经高温和低温胁迫处理后均明显上调。【结论】苹果OFP基因家族共有28个成员,分布于13条染色体上,该家族成员呈现出不同的组织表达模式和胁迫响应模式。

关 键 词：苹果 OFP基因家族  系统进化 胁迫 基因表达

分 类 号：S661.1]