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期刊文章详细信息

12个辣椒microRNA的靶标预测及表达分析    

Targets Prediction and Expression Analysis of 12 microRNAs in Pepper

  

文献类型:期刊文章

作  者:孟纯阳[1,2] 魏小春[1] 赵艳艳[1] 原玉香[1] 杨双娟[1] 王志勇[1] 张晓伟[1] 郑直[1] 姚秋菊[1] 张强[1]

Meng Chunyang;Wei Xiaochun;Zhao Yanyan;Yuan Yuxiang;Yang Shuangjuan;Wang Zhiyong;Zhang Xiaowei;Zheng Zhi;Yao Qiuju;Zhang Qiang(Institute of Horticulture, He'nan Academy of Agricultural Sciences, Zhengzhou, 450002;College of Life Science, Zhengzhou University, Zhengzhou, 450001)

机构地区:[1]河南省农业科学院园艺研究所,郑州450002 [2]郑州大学生命科学学院生物工程系,郑州4500001

出  处:《分子植物育种》

基  金:国家大宗蔬菜产业技术体系豫北综合试验站项目(CARS-23-G-16);特色蔬菜产业技术体系郑州综合试验站(CARS-24-G-13);农业部黄淮海(河南)蔬菜观测站(10205020)共同资助

年  份:2018

卷  号:16

期  号:12

起止页码:3820-3829

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘  要:为了探索12个辣椒microRNA的时空表达及胁迫响应。根据辣椒中已鉴定和注释的microRNA信息,进行靶标预测和时空表达分析。靶标除转录因子外,还有ABC transporter、WD40和锌指结构等。辣椒中miRNA表达具有组织特异性,并且miRNA在果实发育中也起作用。同时,对辣椒进行脱落酸、茉莉酸甲酯、高温、低温、盐和辣椒疫病病原菌处理。采用实时荧光定量PCR检测12个miRNA在不同处理下的表达情况。结果发现micro RNA对胁迫有响应,对胁迫呈现出显著性表达差异,miR4414b受疫病胁迫上调表达,miR167在脱落酸胁迫下下调表达,miR396d经脱落酸、茉莉酸甲酯和疫病诱导后,显著上调表达。miR156在高温和低温胁迫下下调,靶标转录因子SBP可能上调,适应胁迫反应。但miR156a经NaCl诱导后显著上调表达,可能导致靶标下调表达。miR171c经脱落酸、茉莉酸甲酯和疫病处理显著下调,靶标GRAS基因可能上调抵抗胁迫,本研究对辣椒中miRNA的进一步研究提供帮助。

关 键 词:辣椒 MICRORNA 靶标 胁迫 表达分析  

分 类 号:S641.3]

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