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栖息于青藏高原不同海拔环境的两种草原毛虫miRNA转录组的比较分析
Comparative analysis of the micro RNA transcriptomes between two Gynaephora species(Lepidoptera: Lymantriinae) inhabiting different high altitudes of the Tibetan Plateau
文献类型:期刊文章
YANG XingZhuo;ZHANG QiLin;LI Min;JIA ChengLin;ZHOU MinQiang;Yuan MingLong(State Key Laboratory of Grassland Agro-Ecosystems, College of Pastoral Agricultural Science and Technology, Lanzhou University, Lanzhou 730020, China;Key Laboratory of Grass and Animal Husbandry Innovation of Ministry of Agriculture, Lanzhou University, Lanzhou 730020, China;National Demonstration Center for Experimental Grassland Science Education (Lanzhou University), Lanzhou 730020, China;Evo-devo Institute, School of Life Sciences, Nanjing University, Nanjing 210023, China)
机构地区:[1]兰州大学草地农业科技学院,草地农业生态系统国家重点实验室,兰州730020 [2]兰州大学,农业部草牧业创新重点实验室,兰州730020 [3]草业科学国家级实验教学示范中心(兰州大学),兰州730020 [4]南京大学生命科学学院,演化发育生物学研究所,南京210023
基 金:长江学者和创新团队发展计划(批准号:IRT_17R50); 国家现代农业产业技术体系(批准号:CARS-34); 高等学校学科创新引智计划(批准号:B12002)资助
年 份:2018
卷 号:48
期 号:6
起止页码:671-683
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2017、CSCD、CSCD2017_2018、JST、PUBMED、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:有关动物适应异质性海拔环境的研究,已在表型、解剖学、生理学、基因组学和转录组学等方面广泛开展,但是很少关注小RNA(micro RNAs或miRNAs)的生态适应性功能.草原毛虫是青藏高原高寒草地的重要害虫,并对不同海拔环境产生了良好的适应性.为此,本研究以两种栖息于青藏高原不同海拔环境的黄斑草原毛虫和门源草原毛虫为研究对象,基于Illumina Hi Seq技术对这两种草原毛虫的miRNA转录组进行了高通量测序.结果表明,两种草原毛虫中共鉴定到109个成熟miRNAs,其中47个为保守miRNAs.在所有miRNAs种,共有9个miRNAs的表达水平在两种草原毛虫间存在显著差异性.对这9个差异性表达的miRNAs采用实时荧光定量PCR进行验证,发现8个基因的表达水平与高通量测序结果完全一致.功能分析表明,差异性表达的miRNAs共预测到93个靶基因.这些靶基因主要富集到脂、核酸和维生素等代谢或衰老相关的GO条目,并与代谢、抗寒和低氧等KEGG通路相关(如AMPK信号通路、Wnt信号通路和m TOR信号通路).这些研究表明,miRNAs在草原毛虫对异质性海拔环境的适应性进化过程中具有重要作用.该研究加深了对青藏高原特有昆虫适应高海拔环境的遗传基础的理解.
关 键 词:毒蛾亚科 小RNA 基因表达 青藏高原 高海拔适应
分 类 号:S812.6[草学类]
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引证文献:
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