文献类型：期刊文章

作　　者：黄庆[1] 唐乐丽[1] 王晓萌[1] 范新炯[2] 李荷[1]

Huang Qing;Tang Leli;Wang Xiaomeng;Fan Xinjiong;Li He(Department of Biochemistry ＆ Molecular Biology, School of Basic Courses, Guangdong Pharmaceutical University, Guangzhou, 510006;College of Basic Medical Sciences, Anhui Medical University, Hefei, 230000)

机构地区：[1]广东药科大学基础学院生物化学与分子生物学系,广州510006 [2]安徽医科大学基础医学院,合肥230000

出　　处：《基因组学与应用生物学》

基　　金：国家自然科学基金项目(3140068);广东省科技厅项目(2013B010404044;2017A010105011);广东省教育厅项目(2013KJCX0107;2016KTSCX067);广东省“攀登计划”(pdjh2017b0262)共同资助

年　　份：2018

卷　　号：37

期　　号：4

起止页码：1457-1464

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2017_2018、JST、RCCSE、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：利用生物信息学方法对β-葡萄糖苷酶Bgl2238的氨基酸序列进行分析。采用Prot Param、DNAMAN、Multicoil、SOPMA、PROSAN等软件对其理化性质、亲/疏水性、不稳定指数、PEST序列、蛋白质二级结构及蛋白质修饰位点等重要参数进行预测,并对其三级结构进行同源建模及模建结果质量的评估。结果发现：Bgl2238由745个氨基酸组成,蛋白质序列中α-螺旋占36.64%,β-延伸链占19.06%,β-转角占9.40%,无规则卷曲占34.90%,存在14段非PEST序列,具有41个不同蛋白质修饰位点。采用在线网站SWISS-MODEL建模得到了Bgl2238的三级结构,分析蛋白质可及性并分析得到Ramachandran图,检测结果说明三维结构是合理的。本研究结果为β-葡萄糖苷酶Bgl2238进一步研究水解功能及提高其酶活性奠定了理论基础。

关 键 词：Β-葡萄糖苷酶 同源建模 生物信息学

分 类 号：Q55] Q811.4