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期刊文章详细信息

基于肠道菌群结构预测摄入益生元后双歧杆菌的变化趋势    

A machine learning model based on initial gut microbiome data for predicting changes of Bifidobacterium after prebiotics consumption

  

文献类型:期刊文章

作  者:罗月梅[1,2] 刘斐童[1,2] 陈慕璇[2] 唐文丽[2] 杨月莲[2,3] 谭细兰[1,2,4] 周宏伟[1,2]

LUO Yuemei;LIU Feitong;CHEN Muxuan;TANG Wenli;YANG Yuelian;TAN Xilan;ZHOU Hongwei(Department of Environmental Health, School of Public Health, Southern Medical University, Guangzhou 510515, China;State Key Laboratory of Organ Failure Research, Division of Laboratory Medicinal, Department of Geriatrics;Department of Infectious Diseases;Zhujiang Hospital, Southern Medical University, Guangzhou 510282, China)

机构地区:[1]南方医科大学公共卫生学院环境卫生学系,广东广州510515 [2]南方医科大学珠江医院检验医学部器官衰竭研究国家重点实验室 [3]南方医科大学珠江医院老年病科 [4]南方医科大学珠江医院感染科,广东广州510282

出  处:《南方医科大学学报》

基  金:国家自然科学基金优秀青年基金(31322003);国家自然科学基金(31270152)~~

年  份:2018

卷  号:38

期  号:3

起止页码:251-260

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2017、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、EMBASE、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:目的研究益生元干预对肠道菌群的影响,基于肠道菌群数据建立模型预测摄入益生元后双歧杆菌的变化。方法将35名健康志愿者随机分为2组,分别接受16 g/d低聚果糖(FOS)或低聚半乳糖(GOS)干预,干预时间9 d,采集第0、5、9天粪便标本进行16s r RNA基因高通量测序分析,分析两种益生元干预对肠道菌群结构、多样性与功能的影响。用随机森林方法区分益生元干预5 d后双歧杆菌变化,并用初始的菌群构建一个连续型指数(index),实现指数与双歧杆菌实际变化量相关联,而后,对模型进行验证。结果 FOS干预5 d后降低肠道菌群α多样性,9 d时回升,GOS在干预5、9 d时α多样性均下降。两种益生元对β多样性影响均无统计学意义(P>0.05)。通过随机森林方法建立的预测模型,ROC曲线下面积为89.6%;建立的指数与双歧杆菌变化量关联r值为0.45(P<0.01),验证模型r值为0.62(P<0.01)。结论益生元干预可迅速降低肠道菌群α多样性。根据干预前的肠道菌群预测服用益生元后双歧杆菌的变化,预测效果良好,此方法为精准膳食的实现奠定基础。

关 键 词:益生元 低聚果糖 低聚半乳糖 肠道菌群 精准膳食  双歧杆菌

分 类 号:R151]

参考文献:

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同被引文献:

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