文献类型：期刊文章

作　　者：赵庆英[1] 张瑞娟[2] 王瑞良[2] 高建华[2,3] 韩渊怀[3,4] 杨致荣[1,3,4] 王兴春[2,3,4]

ZHAO Qing-Ying;ZHANG Rui-Juan;WANG Rui-Liang;GAO Jian-Hua;HAN Yuan-Huai;YANG Zhi-Rong;WANG Xing-Chun(College of Arts and Sciences, Shanxi Agricultural University, Taigu 030801, Shanxi, China;College of Life Sciences, Shanxi Agricultural University, Taigu 030801, Shanxi, China;Institute of Agricultural Bioengineering, Shanxi Agricultural University, Taigu 030801, Shanxi, China;Shanxi Key Laboratory of Genetic Resources and Genetic Improvement of Minor Crops, Taigu 030801, Shanxi, China)

机构地区：[1]山西农业大学文理学院,山西太谷030801 [2]山西农业大学生命科学学院,山西太谷030801 [3]山西农业大学农业生物工程研究所,山西太谷030801 [4]杂粮种质资源发掘与遗传改良山西省重点实验室,山西太谷030801

出　　处：《作物学报》

基　　金：国家自然科学基金项目(31471502;31600289;31371693;31771810);山西省自然科学基金项目(201601D011071);山西省回国留学人员科研资助项目(2015-067);山西省留学回国人员科技活动择优资助项目(2014-11)资助~~

年　　份：2018

卷　　号：44

期　　号：5

起止页码：686-696

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2017_2018、EBSCO、FSTA、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：小米因其营养丰富日益受到重视,而小米的品质是民众选择小米时最为关注的指标。晋谷21米质优异,但由于缺少基因组信息,严重阻碍了其优异米质形成机制的研究。本研究利用高通量测序技术,对晋谷21全基因组进行重测序,获得了14.95 Gb高质量测序数据。进一步将其与豫谷1号参考基因组比较,发掘了169 037个In Del位点和1 167 555个SNP位点,其中长度在13~50 bp之间适于琼脂糖凝胶电泳检测的In Del位点为14 578个。选择其中1个SNP位点和68个In Del位点验证,表明利用二代测序技术开发的In Del和SNP标记真实可靠。基于名优谷子晋谷21重测序数据开发的In Del和SNP分子标记具有通用性,可用于其他谷子、狗尾草和谷莠子等种质资源的相关研究。同时,开发了一个晋谷21特异的In Del标记2G5501976,利用该标记即可快速鉴定待测材料是否为晋谷21及其衍生品种。本研究初步揭示了晋谷21的基因组特征,不仅为深入解析其优异米质形成的分子机制奠定了基础,而且为相关分子标记辅助育种、遗传分析和基因克隆提供了分子标记资源。

关 键 词：谷子 晋谷21  INDEL SNP 分子标记 基因组重测序  

分 类 号：S515]