期刊文章详细信息
弓形虫ROP16_Ⅱ效应分子对宿主A549细胞基因表达谱的影响
Difference of expression profiling of A549 cells induced by Toxoplasma effector ROP16_Ⅱ
文献类型:期刊文章
SU Ya-jing;DONG Hui;QIAO Xia;WANG Yun-jie;LIU Xue-lei;YANG Ning-ai;ZHAO Zhi-jun(Ningxia Key Laboratory of Clinical and Pathogenic Microbiology, General Hospital of Ningxia Medical University, Yinchuan 750004, China;General Hospital of Ningxia Medical University, Yinchuan 750004, China;Ningxia Medical University, Yinchuan 750004, China)
机构地区:[1]宁夏医科大学总医院宁夏临床病原微生物重点实验室,银川750004 [2]宁夏医科大学总医院医学实验中心,银川750004 [3]宁夏医科大学,银川750004
基 金:国家自然科学基金(No.81560333);宁夏医科大学校级课题(No.XM2016067)联合资助~~
年 份:2018
卷 号:34
期 号:4
起止页码:323-329
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2017_2018、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:目的 ROPl6在弓形虫入侵宿主细胞的过程中发挥着关键作用。为了提高ROP16对宿主细胞的分子功能的认识,本研究分析了ROP16_Ⅱ基因转染的A549细胞株的表达谱,筛选了新的候选基因,为揭示Ⅱ型弓形虫病的发病机制提供了依据。方法通过表达谱芯片技术对过表达ROP16_Ⅱ的A549细胞株的表达谱进行研究,并从中筛选差异表达基因。利用ToppGene从差异表达基因中筛选候选基因,并通过RT-qPCR对获得的基因进行验证。结果共获得了9 994个差异表达基因,其中上调的基因有4 293个,下调的基因有5 701个。将这些差异表达基因进行GO功能富集分类,主要涉及多种生物学过程,包括发育过程、生物调控、免疫应答和信号传导等过程。采用ToppGene筛选得到4个疾病候选基因,其中上调表达的有IL4R和STAT1;下调表达的有IL12RB1和IL2RG。RT-qPCR结果与表达谱芯片数据一致。结论 ROP16_Ⅱ入侵宿主细胞后影响宿主细胞基因表达谱,了解ROP16_Ⅱ的作用机制,对于更加全面地揭示Ⅱ型弓形虫病的发病机制具有重要意义。
关 键 词:ToppGene ROP16 表达谱 弓形虫
分 类 号:R382.5]
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