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期刊文章详细信息

新发猪Delta冠状病毒和猪流行性腹泻病毒SYBR GreenⅠ双重荧光RT-PCR检测方法的建立及应用    

Establishment and application of a duplex SYBR Green Ⅰ real-time RT-PCR assay for simultaneous detection of emerging PDCoV and PEDV

  

文献类型:期刊文章

作  者:张利卫[1,2] 曹贝贝[1] 李炳晓[1,2] 张云飞[1,2] 韦学雷[1] 韩丽[1] 胡慧[1,2]

ZHANG Li-wei;CAO Bei-bei;LI Bing-xiao;ZHANG Yun-fei;WEI Xue-lei;HAN Li;HU Hui(College of Anita al Science and Veterinary Medicine, Henan Agricultural University, Zhengzhou 450002, China;Key Laboratory for Anita al-derived Food Safety of Henan Province, Zhengzhou 450002, China)

机构地区:[1]河南农业大学牧医工程学院,河南郑州450002 [2]河南省动物性食品安全重点实验室,河南郑州450002

出  处:《中国兽医学报》

基  金:国家重点研发计划基金资助项目(2016YFD0500102);河南省科技开放合作基金资助项目(152106000047)

年  份:2018

卷  号:38

期  号:4

起止页码:618-624

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2017_2018、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘  要:猪Delta冠状病毒(porcine delta coronavirus,PDCoV)是一种新发现的仔猪腹泻类冠状病毒,感染仔猪主要表现出水样腹泻、呕吐和脱水等临床症状,和猪流行性腹泻(porcine epidemic diarrhea,PED)临床症状极其类似,且I临床上混合感染病例较多,单靠临床症状和剖检变化很难辨别这2种疾病,因此建立同时检测且能区分PDCoV和PEDV的检测方法具有重要意义。参照GenBank登录的PDCoVM基因和PEDVORF3基因特异性序列设计引物,扩增相应的基因片段,克隆构建重组质粒pMD-18T—PDCovM与pMD-18T—PEDVORF8,测序验证后,分别以此重组质粒为标准品,建立了能同时检测PDCoV和PEDV的SYBRGreenI双重荧光RTPCR方法,并对其扩增体系和扩增条件等进行了优化,同时对所建立的双重荧光RT—PCR方法的特异性、灵敏性和重复性进行了检测。结果显示,该试验成功建立了能同时检测PDCov和PEDv的SYBRGreenI双重荧光RTPCR方法,最低能检测到PDCoV和PEDV分别是28.6拷贝/μL和99.6拷贝/μL的质粒浓度,显示出较好的敏感性;在同样扩增条件下该方法具有较好的重复性;特异性试验表明,该方法仅能检测出PEDV和PDCoV,而对猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪圆环病毒2型(PCV2)和猪伪狂犬病毒(PRV)等均不产生特异性扩增曲线。将所建立的双重荧光RTPCR方法以及单重荧光定量RT—PCR方法分别对198份临床收集的仔猪腹泻样品进行PEDV和PD—CoV检测,结果显示,PDCoV阳性样品41份,阳性率为20.7%;PEDV阳性样品59份,阳性率为29.8%;同时感染这2种病毒的样品17份,阳性率为8.6%。与单重荧光定量RT—PCR方法对PEDV和PDCoV的检出率一样,符合率100.0%。本研究成功建立了PDCoV和PEDV的双重荧光RT—PCR方法,能同时准确地检测PDCoV和PEDV,这为PDCoV和PEDV的临床鉴别诊断和流行病学�

关 键 词:猪Delta冠状病毒(PDCoV)  猪流行性腹泻病毒(PEDV)  双重荧光RT—PCR  SYBR Green  I  

分 类 号:S855.3] S852.65[动物医学类]

参考文献:

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耦合文献:

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引证文献:

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同被引文献:

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