文献类型：期刊文章

作　　者：廖钦洪[1,2] 邹勇[1] 李洪雷[1] 姜玉松[1,2]

LIAO Qin-hong;ZOU Youg;LI Hong-lei;JIANG Yu-song(Research Institute for Special Plants, Chongqing University of Arts and Sciences, Chongqing 402160, China;Collabrative Innovation Center for Special Plant Industry of Chongqing, Chongqing 402160, China)

机构地区：[1]重庆文理学院特色植物研究院,重庆402160 [2]重庆市特色植物产业协同创新中心,重庆402160

出　　处：《中国中药杂志》

基　　金：国家自然科学青年基金项目(31501273);重庆市前沿与应用基础研究项目(cstc2015jcyj A8003)

年　　份：2018

卷　　号：43

期　　号：3

起止页码：493-501

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、EMBASE、IC、IPA、JST、PUBMED、RCCSE、RSC、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：NAC家族是植物特有的转录因子,广泛参与植物生长发育、信号传导和逆境应答等过程。该研究基于生姜RNA-seq数据,利用生物信息学方法对生姜NAC家族成员、亚族分类、理化性质、蛋白质结构和表达模式进行预测和分析,结果显示：在271.1 Mb生姜转录组数据中筛选得到72个生姜NAC转录因子,通过进化树分析将其分为13个亚族;不同亚族NAC蛋白质的理化性质,如氨基酸数目、等电点等存在差异,二级结构主要以无规则卷曲为主要构成元件,三级结构相似性较高;23个NAC转录因子在不同土壤湿度及青枯菌Ralstonia solanacearum侵染处理下呈现显著的表达差异,其主要分布在与植物衰老、激素代谢和细胞壁代谢相关的第Ⅻ,ⅩⅤ,Ⅷ亚族。该研究结果为生姜NAC基因家族的研究和利用提供了理论依据。

关 键 词：生姜 NAC转录因子 RNA-SEQ 基因差异表达

分 类 号：S632.5]