文献类型：期刊文章

作　　者：周俊飞[1] 崔野韩[2] 唐浩[2] 李论[1] 陈红[2] 温雯[2] 韩瑞玺[2] 黄思思[2] 方治伟[1] 彭海[1]

ZHOU JunFei;CUI YeHan;TANG Hao;LI Lun;CHEN Hong;WEN Wen;HAN RuiXi;HUANG SiSi;FANG ZhiWei;PENG Hai(Institute for Systems Biology, Jianghan University, Wuhan 430056;Development Center of Science and Technology of Ministry of Agriculture, Beijing 100122)

机构地区：[1]江汉大学系统生物学研究院,武汉430056 [2]农业部科技发展中心,北京100122

出　　处：《中国农业科学》

基　　金：生物产业共性技术标准研究(2016YFF0202300);湖北省自然科学基金青年科学(2017CFB229)

年　　份：2018

卷　　号：51

期　　号：6

起止页码：1013-1019

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、FSTA、GEOBASE、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：【目的】植物品种分子标记鉴定标准只抽检了基因组上部分标记位点,存在抽样误差,鉴定结论常常因此被质疑。估计植物品种分子标记鉴定位点的抽样误差与鉴定结论的可靠性,为品种分子鉴定标准的应用提供科学依据。【方法】以2个品种间观察到的差异位点的数目为条件,根据贝叶斯公式建立品种间真实差异位点数目的条件概率模型。根据观察到的差异位点的数目服从于二项分布,且真实差异位点数的先验概率近似于均匀分布的特点,实现条件概率模型的计算。根据概率模型获得的概率保障的大小,将品种间的关系划分为红区、绿区和黄区,对应相同或近似品种、不同品种和待定品种。利用8个水稻品种的3 205个SSR分子标记位点的分型结果,估计2个品种组合间的真实差异水平,进而判定品种间关系的真实值。对每一对品种进行10 000次的分子标记位点的模拟抽样,每次抽取48个SSR标记位点。根据每次模拟抽样的结果,按概率模型计算概率并判定品种间的关系,将判定结论与真实值比较,验证概率模型的准确性。最后,利用概率模型为近期的西瓜品种侵权案的判决结论提供概率支持。【结果】在模拟抽样的验证试验中,每个品种组合有4 295—10 000次随机抽样在95%的概率保障下,判定为不同品种。与品种间的真实关系比较表明,利用概率模型鉴定的水稻品种间关系的正确率为100%。最后,利用概率模型为最近的西瓜品种侵权案的判决结论的正确性提供了95%以上概率保障,败诉方对抽样位点不足导致判决不可靠的质疑理由并不充分。【结论】构建了一个评估品种间关系、判定结论可靠性的概率模型,为品种间关系的分子鉴定结论赋予了概率保证,提高品种间关系判定结论的准确性,避免因检测位点不足导致的争议。

关 键 词：品种鉴定  分子标记 抽样误差

分 类 号：S188]