文献类型：期刊文章

作　　者：张西燕[1] 付玉荣[2] 伊正君[1]

ZHANG Xi yan1 , FU Yu-rong2 , YI Zheng-jun1(1. Department of Medical Laboratory Science, Weifang Medical University, Wei fang, Shandong 261053, China ; 2. Department of Pathogen Biology, Wei fang Medical University)

机构地区：[1]潍坊医学院医学检验学系,山东潍坊261053 [2]潍坊医学院病原生物学教研室

出　　处：《中国病原生物学杂志》

基　　金：国家自然科学基金项目(No.30972639);山东省自然科学基金项目(No.ZR2016HM09)

年　　份：2018

卷　　号：13

期　　号：2

起止页码：140-145

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CAB、CSCD、CSCD_E2017_2018、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的获取结核分枝杆菌(H37Rv)的eis基因序列及其编码蛋白(Eis蛋白)的氨基酸序列,预测和分析该蛋白的结构和功能。方法从NCBI BenBank数据库获取eis基因及其编码蛋白序列,利用ORF Finger工具分析eis基因的开放阅读框;利用Expasy PortParam、SignalP 4.0Server、TMHMM Server v.2.0、SOPMA、BLAST、SWISS-MODEL、ABCpred、SYFPEITHI以及NetMHCIIpan 3.1Server等软件对Eis蛋白的生物学特性进行预测分析。结果结核分枝杆菌eis基因全长1 164bp,有7个开放阅读框,最长一个被通读,编码387个氨基酸。Eis蛋白分子式C1870H2958N550O542S11,等电点(pI)为6.46,属于不稳定、疏水性蛋白;无跨膜区,信号肽切割位点位于第21位氨基酸处;二级结构预测无规则卷曲占30.23%,含有一个保守结构域;建立同源三级模型,GMQE为0.98;预测该蛋白至少含有6个B细胞优势抗原表位和14个优势CTL表位。优势抗原表位数个。结论生物学信息学方法预测结核分枝杆菌的Eis蛋白具有优势T、B细胞抗原性表位,所含保守结构域与其功能密切相关。eis基因以及Eis蛋白与结核分枝杆菌抑制细胞自噬及其耐药机制密切相关,可作为抗结核治疗的切入点。

关 键 词：eis基因  Eis蛋白  结核分枝杆菌 巨噬细胞 生物信息学

分 类 号：R378.99]