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期刊文章详细信息

caf1基因为靶标的鼠疫检测PCR法的改进    

Improvement of the cafl based PCR method for detection of the plague

  

文献类型:期刊文章

作  者:张艳[1,2] 郭英[1] 董珊珊[1] 揭云翠[1] 钟佑宏[1] 李伟[3] 宋志忠[4] 王鹏[1]

Zhang Yan, Guo Ying, Dong Shanshan, Jie Yuncui, Zhong Youhong, Li Wei, Song Zhizhong, Wang Peng(Yunnan Provincial Key Laboratory for Zoonosis Control and Prevention, Yunnan Institute for Endemic Disease Control and Prevention, Dali 671000, China (Zhang Y, Guo Y, Dong SS, Jie YC, Zhong YH, Wang P); Department of Epidemialogy and Health Statistics, School of Public Health, University of Dali, Dali 671000, China (Zhang Y); State Key Laboratory for Infectious Disease Prevention and Control, National Institute for Infectious Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Changping 102206, China (Li W); Yunnan Center for Disease Control and Prevention, Kunming 650011, China (Song ZZ))

机构地区:[1]云南省地方病防治所自然疫源性疾病防控技术重点实验室,大理671000 [2]大理大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室,大理671000 [3]中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室,昌平102206 [4]云南省疾病预防控制中心,昆明650011

出  处:《中华地方病学杂志》

基  金:国家自然科学基金(31660043);云南省自然疫源性疾病防控技术重点实验室平台建设项目(2015DG026);云南省中青年学术和技术带头人后备人才培养项目(2014HB037);云南省医学学科带头人培养对象(D-201652)

年  份:2018

卷  号:37

期  号:3

起止页码:203-206

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2017_2018、EMBASE、IC、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘  要:目的查明行业标准推荐caf1基因引物(简称行标caf1引物)进行PCR检测时,在一些非鼠疫菌上出现非特异性条带的原因,并提出解决办法。方法共选取112株菌进行试验,其中鼠疫菌40株、非鼠疫菌72株;提取菌株DNA,并对caf1基因进行PCR扩增;选择出现非特异性条带的7株菌株,进行切胶回收、纯化以及TA克隆测序;针对caf1基因重新设计引物,对被试菌株进行验证。结果使用行标caf1引物扩增40株鼠疫菌,均未出现非特异性条带,扩增72株非鼠疫菌,有58株扩增出400、500、600、700、800、900、1 000 bp的非特异性条带。经克隆和测序,在非特异性产物的基因序列中均出现行标caf1引物的反向引物序列及反向引物的反向互补序列。重新设计caf1引物,扩增72株非鼠疫菌,均未出现非特异性条带。结论行标caf1引物在筛查鼠疫菌时会出现非特异性条带,使用新caf1引物可有效避免这一情况,提高检测的准确性。

关 键 词:caf1基因  耶尔森菌,鼠疫  聚合酶链式反应

分 类 号:R516.8]

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同被引文献:

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