文献类型：期刊文章

作　　者：盛松柏[1] 田菊[2] 庞晓明[1]

机构地区：[1]北京林业大学生物科学与技术学院林木育种国家工程实验室林木花卉遗传育种教育部重点实验室,北京100083 [2]内蒙古和盛生态科技研究院有限公司,呼和浩特011517

出　　处：《分子植物育种》

基　　金：科技部"十二五"国家科技支撑计划(2013BAD14B0302);国家自然科学基金项目(31372019);内蒙古自治区科技重大专项(内财教[2014]2020号)共同资助

年　　份：2018

卷　　号：16

期　　号：1

起止页码：61-68

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：COBRA作为一类GPI锚定蛋白,主要作用于细胞伸长与纤维素沉积。本研究在"冬枣"全基因组中成功地鉴定到10个冬枣COBRA相似基因(ZjCOBL),并对该基因家族成员进行生物信息学分析,还研究了各成员在‘冬枣’7个不同组织中的表达模式。所有潜在的COBRA相似蛋白都具有CCVS保守结构域,其中8个相似蛋白具有N端信号肽序列,big-PI程序预测出7个蛋白为潜在的GPI锚定蛋白。根据基因结构和系统演化分析等依据,冬枣中的COBRA相似蛋白可以分为两个亚家族(SFs),其中SFⅠ亚家族氨基酸相似性为43.3%到79.9%,SFⅡ亚家族为58.3%到67.9%。10个ZjCOBL基因分别位于枣树12条染色体中的5条染色体和一段scaffold上。Real-time RT-PCR试验表明,所有ZjCOBL基因在冬枣各个器官和不同生长时期均有表达。其中,ZjCOBL7与番茄上的Sl COBRA-like为直系同源基因,具有相似的表达模式,推测ZjCOBL7可能与枣果实的质地和成熟软化相关。

关 键 词：冬枣 COBRA基因家族  系统演化分析  基因表达

分 类 号：Q943.2[植物生产类] S665.1]