文献类型：期刊文章

作　　者：蒋芝华[1] 丁棒棒[1] 王熠[1] 丁艳菲[1] 朱诚[1]

机构地区：[1]中国计量大学生命科学学院/浙江省海洋食品品质及危害物控制技术重点实验室,浙江杭州310018

出　　处：《核农学报》

基　　金：浙江省自然科学基金资助项目(L214CO20001);浙江省海洋食品品质及危害物控制技术研究重点实验室开放基金(2014E10004)

年　　份：2018

卷　　号：32

期　　号：4

起止页码：673-680

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：为筛选石首科鱼类物种鉴定的最优DNA条形码,本试验对大黄鱼、小黄鱼、黄姑鱼和棘头梅童鱼4种鱼类71份样本的细胞色素氧化酶亚基I(COI)、线粒体控制区(D-loop)和16S rRNA 3种基因序列进行PCR扩增和测序,分析比较各基因序列比对鉴定能力、种内和种间差异、barcoding gap检验以及序列多态性。结果表明,3种候选DNA条形码序列的种间遗传距离均高于种内遗传距离,符合作为DNA条形码的基本要求。通过遗传差异和barcoding gap检验分析发现,COI和D-loop区适合作为鉴定大黄鱼、小黄鱼、黄姑鱼和棘头梅童鱼4种石首科鱼类的DNA条形码;16S rRNA基因存在一定的缺陷,但是D-loop区和16S rRNA基因序列可能存在比COI通用序列更为有效的DNA条形码区域。考虑引物通用性,推荐COI基因作为最适DNA条形码。本研究结果为海洋鱼类的快速鉴定提供了一定的参考依据。

关 键 词：石首鱼 DNA条形码 COI 鉴定  

分 类 号：S917.4[水产类]