期刊文章详细信息
基于ITS2高通量测序研究强直性脊柱炎患者肠道真菌特征
Characteristics of the intestinal fungal microbiota in patients with ankylosing spondylitis based on ITS2 high-throughput sequencing
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]大连医科大学基础医学院微生态学教研室,辽宁大连116044 [2]大连医科大学基础医学院免疫学教研室,辽宁大连116044 [3]辽宁国际旅行卫生保健中心,辽宁大连116001
基 金:中国博士后科学基金(2016M601317);辽宁省大学生创新创业项目(2017101610100031)
年 份:2018
卷 号:30
期 号:2
起止页码:125-131
语 种:中文
收录情况:AJ、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD_E2017_2018、IC、JST、PROQUEST、ZGKJHX、普通刊
摘 要:目的探究强直性脊柱炎(ankylosing spondylitis,AS)患者肠道真菌菌群的多样性特征,分析健康人群与AS患者肠道真菌的结构差异。方法收集17例健康人群新鲜粪便样本和24例AS患者新鲜粪便样本,分别称为HC组和AS组,提取两组粪便样本总DNA;根据真菌ITS2区设计引物进行扩增,利用Illumina HiSeq PE250平台进行ITS2高通量测序;测序结果经过Reads拼接,OTUs(operational taxonomic units)聚类,Alpha和主成分分析,物种组成统计,显著性差异分析,最终得到样本物种信息。结果对肠道真菌菌群进行Alpha分析,各多样性指标中,shannon和observed_species指数差异有统计学意义(P<0.05),其余指数差异均无统计学意义,故不能明确两组间多样性的差异。主成分分析提示差异显著。对肠道真菌结构进行分析,门的水平分析显示,担子菌门(Basidiomycota)在HC组和AS组中差异显著,接合菌门(Zygomycota)在两组间差异极显著;纲和属的水平分析显示,Ascomycota_unidentified纲在两组中差异显著,伞菌纲(Agaricomycetes)、Incertae_sedis_10纲、Orbiliomycetes纲差异极显著。Agaricomycetes_unidentified_1属、Amphinema属、Geoglossales_unidentified_1属、腔块菌属(Hydnotrya)差异显著,鹅膏菌属(Amanita)和锁瑚菌属(Clavulina)差异极显著。结论本实验证实了在AS患者中存在肠道真菌菌群失调,其特征是生物多样性和结构的改变,揭示肠道真菌也可能在AS发病中发挥作用。
关 键 词:肠道真菌 强直性脊柱炎 ITS2高通量测序
分 类 号:R379]
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