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期刊文章详细信息

小麦ARF基因家族生物信息学分析及在干旱胁迫下的表达特性研究    

Bioinformatics Identification of Auxin Response Factor Genes and Expression Profiles under Drought Stress in Wheat

  

文献类型:期刊文章

作  者:孙仁玮[1,2,3] 刘永杰[2,3] 王翔[4,3] 张荃[5] 张立平[2,3] 孙辉[2] 王永波[2] 高建刚[2] 杨卫兵[2] 赵昌平[2,3] 高世庆[2,3] 韩俊[1]

机构地区:[1]北京农学院植物科学技术学院,北京102206 [2]北京杂交小麦工程技术研究中心,北京100097 [3]杂交小麦分子遗传北京市重点实验室,北京100097 [4]华中农业大学植物科学技术学院,武汉430070 [5]山东师范大学生命科学院,济南250014

出  处:《植物遗传资源学报》

基  金:国家自然科学基金(31571641);北京市自然科学基金项目(6162009);北京农林科学院储备项目(KJCX20170421);国家自然科学基金.国际(地区)合作与交流项目(31661143018)

年  份:2018

卷  号:19

期  号:1

起止页码:122-134

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2017、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘  要:植物生长素响应因子ARF(auxin response factor)参与调节了植物的向性运动、顶端优势、微观的分化、侧根和茎的形态发生等众多生理反应,在植物生长发育的整个过程都起到重要调控作用。本研究通过对小麦最新基因组数据进行分析,获得了61个ARF家族基因,命名为TaARFs,根据染色体编号排列为TaARF1~TaARF61,对61个TaARFs基因进行系统生物信息学分析后发现ARF家族基因结构较为复杂,外显子数量从1个到15个变化不等,除了4号染色体和5A和5B染色体之外,其余的染色体均有ARF家族基因分布。ARF家族基因大多包含B3 DNA结构域、ARF结构域(Auxin-resp)和Aux/IAA结构域;同源进化分析表明,小麦ARF家族基因的旁系同源基因数量明显多于大麦和二穗短柄草。通过拟南芥数据库比对获得14个高同源的根系发育相关的小麦ARF家族基因,利用二系杂交小麦京麦6号及父母本根系为试材进行干旱胁迫处理及实时荧光定量PCR(qPCR)筛选。结果表明,7个小麦ARF基因不同程度受到干旱胁迫诱导,其在旱胁迫下的表达量显著高于正常条件下的表达量,可能参与干旱胁迫应答;此外本研究还发现,ARF基因在F1杂交种中表达量显著高于双亲,表现出超亲表达模式,可能参与了根系抗旱杂种优势基因表达调控网络。

关 键 词:小麦 ARF家族  生物信息学 根系发育 干旱胁迫

分 类 号:S512.1]

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