文献类型：期刊文章

作　　者：刘元[1] 李守婷[1] 申进文[2] 文春南[1] 文晴[2] 阮元[1] 麻兵继[1]

机构地区：[1]河南农业大学中药材系,河南郑州450002 [2]河南农业大学生物系,河南郑州450002

出　　处：《浙江农业科学》

基　　金：国家自然科学基金(U1604169);河南省教育厅科学技术研究重点项目(14A360006)

年　　份：2018

卷　　号：59

期　　号：1

起止页码：64-68

语　　种：中文

收录情况：普通刊

摘　　要：采用GSS高通量测序技术分别测定怀山药根和茎中内生真菌的内转录间隔区ITS序列,将真菌归类到种或亚种水平。用Qiime和Mothur等软件分析样品的序列数目和操作单元数量,进而分析物种的丰度和Alpha多样性。本试验从怀山药根和茎分别获得的有效序列数为64 774条和273 930条;根、茎OTU数分别为268、308。其中根部内生真菌含5门,14纲,36目,65科,92属,109种;茎部内生真菌包含4门,14纲,38目,66科,95属,112种。结果表明,怀山药根、茎中内生真菌非常丰富,且茎中内生真菌多样性程度略高于根。根的优势菌群为葡萄孢盘菌属(Botryotinia),茎的优势菌群为链格孢属(Alternaria)。

关 键 词：怀山药 内生真菌 GSS高通量测序  内生真菌多样性  

分 类 号：S567]