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猪Delta冠状病毒、猪传染性胃肠炎病毒和猪流行性腹泻病毒多重RT-PCR检测方法的建立及应用
Establishment and application of a multiplex RT-PCR assay for simultaneous detection of porcine delta coronavirus,porcine transmissible gastroenteritis virus and porcine epidemic diarrhea virus
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]河南农业大学牧医工程学院,河南郑州450002 [2]河南省动物性食品安全重点实验室,河南郑州450002
基 金:国家重点研发计划资助项目(2016YFD0500102);河南省科技开放合作资助项目(152106000047)
年 份:2018
卷 号:38
期 号:1
起止页码:11-16
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2017_2018、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:猪Delta冠状病毒(PDcoV)、猪流行性腹泻病毒(PEDV)和猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)均是能引起仔猪腹泻的冠状病毒,通过临床症状和剖检很难鉴别诊断,建立同时检测且能够鉴别诊断这3种疾病的快速检测方法对于临床诊断具有重要的意义。参照GenBank中登录的PDCoV,NPEDVM和TGEVN基因的基因序列,利用Primer5.0设计合成3对能扩增特异性目的片段的引物,构建重组质粒,并对RT-PCR反应条件进行优化,建立了检测PDCoV,PEDV和TGEV的多重RT—PCR诊断方法,并对所建立的方法进行敏感性、特异性和重复性分析。利用该方法对河南176份临床样品进行检测,并与普通RT-PCR检测方法对该检测方法进行比较分析。结果表明,所建立的三重RT-PCR方法对PDCoV的最低检测量是3.14×10 3拷贝/uL;PEDV的最低检测量是3.88×10 4拷贝/uL和TGEV的最低检测量是3.68×10 4拷贝/uL。所建立的方法具有较好的特异性,对猪博卡病毒(PboV)、猪伪狂犬病病毒(PRV)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪瘟(CSFV)和猪圆环病毒(PCV)等猪常见病毒的扩增结果均为阴性。应用所建立的三重RT-PCR方法对176份临床收集的仔猪腹泻样品进行PEDV,PDCoV和TGEV检测,并将检测结果和单重RT-PCR检测方法比较,结果显示,多重RT—PCR检测结果与常规单一RT~PCR的结果符合率均为100%。综上,本试验建立了能同时检测PDCoV,PEDV和TGEV的三重RT—PCR方法,为临床上这3种疫病的快速检测和流行病学调查奠定了基础。
关 键 词:猪Delta冠状病毒 猪流行性腹泻病毒 猪传染性胃肠炎病毒 多重RT—PCR方法
分 类 号:S852.65]
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