期刊文章详细信息
基于cDNA-AFLP技术分析半膜覆盖下玉米大喇叭口期基因差异表达
Differentially Expressed Genes in Partial Plastic Film-mulched Cultivation of Maize at Bell Stage Based on cDNA-AFLP Technology
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]内蒙古大学生命科学学院,呼和浩特010021 [2]内蒙古大学物理科学与技术学院离子束生物工程重点实验室,呼和浩特010021
基 金:内蒙古科技计划项目(No.20140169);国家重点研发计划项目(No.22016YFD0300309)
年 份:2017
卷 号:38
期 号:12
起止页码:2310-2317
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2014、CSCD、CSCD_E2017_2018、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:为了探讨半膜覆盖调控玉米生长的差异表达基因及分子机制,以‘浚单29’为材料,露地栽培作为对照,与半膜覆盖间隔种植,利用cDNA-AFLP技术,采用90对单引物筛选半膜覆盖下差异表达基因,并进行生物信息学分析。结果表明,利用90对单引物组合共扩增出2 298条差异片段,其中上调表达的有1 429条,占总条带数的45%;下调表达的有869条,占总条带数的23.7%;无差异表达的有877条,占总条带数的27.6%。选择重复扩增稳定的20条差异片段进行回收测序,经过Blast数据库对比和基因注释分析,再将所得的15条差异片段按功能分为细胞骨架相关基因(13.3%)、能量代谢相关基因(13.3%)、细胞挽救和防御相关基因(6.7%)、转录过程相关基因(40%)、胞内转运相关基因(6.7%)和未知功能基因(20%)6大类。分析其中一些重要的基因,如RPM1在逆境抗性中起作用,MYM锌指蛋白、BCAS2蛋白和EIF3B翻译起始因子都与调控转录翻译相关。通过c DNA-AFLP技术筛选了多个半膜覆盖下差异表达的基因,为揭示半膜覆盖影响玉米生长发育的分子机制提供了基础资料。
关 键 词:玉米 栽培方式 半膜覆盖 CDNA-AFLP 差异表达
分 类 号:S513]
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引证文献:
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