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期刊文章详细信息

五加科植物叶绿体基因组结构与进化分析    

Analysis on structure and phylogeny of chloroplast genomes in Araliaceae species

  

文献类型:期刊文章

作  者:宋菊[1] 龙月红[1] 林丽梅[1] 尹峰[1] 邢朝斌[1]

机构地区:[1]华北理工大学生命科学学院,河北唐山063210

出  处:《中草药》

基  金:国家自然科学基金项目(31570683);华北理工大学培育基金资助(SP201508);华北理工大学研究生创新项目(2017S12)

年  份:2017

卷  号:48

期  号:24

起止页码:5070-5075

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、EMBASE、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:目的获取五加科叶绿体基因组的结构特征以及进化关系。方法以已测序完成的10个属的20种五加科植物叶绿体基因组为研究对象,系统比较基因组间的差异,分析4个IR边界扩张与收缩情况,并以近缘物种当归为外类群,使用MEGA 4.0构建系统进化树,分析物种间的亲缘关系。结果 20种五加科植物的叶绿体基因组大小差异较小,最大差仅1 909bp。各物种均出现基因替换现象,由cem A基因替换ycf10基因,且数量存在一定差异,主要由t RNA引起。通过比较发现,五加科物种的4个IR边界比较保守,仅野三七、三七和穗序鹅掌柴的边界基因进入IR区的长度与其他物种的差异较大。以当归为外类构建的系统进化树,各节点的支持率较高,清晰地反映了各物种间的亲缘关系。结论叶绿体基因组涵盖的信息量大,可以用于分析关系较近与进化较快物种的系统发生问题。

关 键 词:五加科 叶绿体基因组 刺五加  人参  三七  穗序鹅掌柴  系统进化

分 类 号:R282.12[中药学类]

参考文献:

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同被引文献:

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