文献类型：期刊文章

作　　者：巩建业[1] 吴喆瑜[1] 李利君[1] 倪辉[1]

机构地区：[1]集美大学食品与生物工程学院福建省食品微生物与酶工程重点实验室,福建厦门361021

出　　处：《现代食品科技》

基　　金：国家自然科学基金资助项目(31371751);福建省农业高校产学合作重大项目(2014N5010)

年　　份：2017

卷　　号：33

期　　号：10

起止页码：13-20

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、EI、IC、PROQUEST、RCCSE、SCOPUS、UPD、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：为了分析糖苷水解酶第78家族(glucoside hydrolase family 78,GH78)中真菌α-L-鼠李糖苷酶保守区及进化关系,本研究应用Clustal W2软件对87条GH78家族真菌α-L-鼠李糖苷酶进行多重序列比对,利用Block Maker进一步分析,得到了该家族真菌的共有完全氨基酸保守位点及保守区;利用Signal P 4.1 Server对序列进行信号肽预测;应用MEGA 6.0软件对Clustal W2结果进行遗传距离分析并构建分子系统进化树。GH78家族真菌87条序列虽然长度不等,但均包含AHGWSTGPTY、VTLDTGQNVAG和NELSIPTDGAKRD 3个保守区及多个完全保守氨基酸位点;87条序列中29条含有信号肽;属间遗传距离为0.7~48.5,种间遗传距离为0.4~48.5;分子系统进化树并不是依靠菌株来源进行聚类,而是依据是否为胞外酶进行聚类。该研究分析了GH78家族真菌α-L-鼠李糖苷酶的保守区及进化关系,为α-L-鼠李糖苷酶的工程改造奠定了基础。

关 键 词：α-L-鼠李糖苷酶  保守区  分子系统进化 进化树

分 类 号：TS201.25]