文献类型：期刊文章

作　　者：徐春光[1,2] 郝永清[2] 郝瑞霞[2] 张玲[2] 刘波[2]

机构地区：[1]呼伦贝尔学院生命与环境科学学院,内蒙古呼伦贝尔021008 [2]内蒙古农业大学兽医学院微生物学与免疫学实验室,内蒙古呼和浩特010018

出　　处：《微生物学通报》

基　　金：国家科技支撑计划项目(No.2011BAD18B01)~~

年　　份：2017

卷　　号：44

期　　号：11

起止页码：2669-2678

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2014、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：【目的】全面了解丝状支原体山羊亚种PG3株的全基因组序列信息,寻找该病原体的主要保护性抗原基因。【方法】利用高通量Illumina Hi Seq 2000测序技术对丝状支原体山羊亚种PG3株的全基因组进行测序与拼接,借助软件和数据库对全基因组序列所承载的遗传信息进行注释和分析。【结果】丝状支原体山羊亚种PG3株基因组大小为1 025 065 bp,G+C%为23.6%,预测含有846个编码基因。根据COG分类和KEGG代谢通路分类,基因组中绝大多数基因主要与蛋白翻译、核糖体结构与合成、DNA复制与修复、糖代谢和环境信号传递与转换方面有关。该菌株具有丝状支原体山羊亚种特有的麦芽糊精/麦芽糖代谢途径。与Mmc str.95010的基因组的比对结果显示二者具有良好的共线性关系。在基因组中发现3个串联排列的可变表面脂蛋白基因,即GL000459、GL000461和GL000462。【结论】获得丝状支原体山羊亚种PG3株的全基因组序列,分析基因组基本特征,初步解析3个串联排列的可变表面脂蛋白基因,为进一步研究支原体可变表面脂蛋白的功能和研制生物工程疫苗奠定基础。

关 键 词：丝状支原体山羊亚种 全基因组序列测定 可变表面脂蛋白  

分 类 号：S852.62]