期刊文章详细信息
基于TCGA数据库的乳腺癌进程关键基因系统筛选和鉴定
A Study of Systematic Screening and Identification of Essential Genes Involved in Breast Cancer Progression Based on TCGA Database
文献类型:期刊文章
FENG Xu;ZHAO Limin;KE Hao;ZHANG Honglei(Faculty of Life Science and Technology,Kunming University of Science and Technology, Kunming 650500, China;State Key Laboratory of Genetic Resources and Evolution, Kunming Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences, Kunming 650223 , China;Kunming College of Life Science, University of Chinese Academy ofSciences, Kunming 650500 , China)
机构地区:[1]昆明理工大学生命科学与技术学院,云南昆明650500 [2]中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室,云南昆明650223 [3]中国科学院大学昆明生命科学学院,云南昆明650500
基 金:科技部重点研发计划项目(2016YFA0100900);云南省应用基础研究计划面上项目(2016FB038)
年 份:2017
卷 号:49
期 号:4
起止页码:93-99
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2014、CAS、IC、JST、MR、RCCSE、ZGKJHX、ZMATH、核心刊
摘 要:利用TCGA数据库收集的乳腺癌转录组数据和病人临床信息,分析基因表达与乳腺癌临床病理学参数的相关性及其对预后的影响,同时结合表达差异分析筛选出与乳腺癌进程密切相关的7个候选基因(UBE2T、RRM2、SGOL1、ERCC6L、CCNE1、HMGB3和SPDYC).通过基因功能注释检索确定SGOL1作为实验验证的候选基因.实验结果表明在乳腺癌细胞系MDA-MB-231中敲降SGOL1能显著抑制细胞生长,细胞周期被阻滞在G2/M期.上述结果表明SGOL1在乳腺癌进程中具有重要作用,同时也说明该生物信息结合实验的筛选方法可以加速肿瘤关键基因的筛选和鉴定.
关 键 词:转录组 TCGA数据库 SGOL1
分 类 号:R857.3]
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