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期刊文章详细信息

大豆基因组中OSCA基因家族的进化和表达分析    

Evolution and expression analysis of OSCA gene family in soybean

  

文献类型:期刊文章

作  者:李建伟[1] 杨珺凯[1] 贾博为[1] 孙明哲[1] 刘瑀[1] 殷奎德[1] 孙晓丽[1]

机构地区:[1]黑龙江八一农垦大学农学院/作物逆境分子生物学实验室,黑龙江大庆163319

出  处:《中国油料作物学报》

基  金:黑龙江八一农垦大学青年创新人才培养项目(CXRC2016-01;2016-KYYWF-0161);黑龙江八一农垦大学引进人才科研启动计划(XYB2015-01);国家自然科学基金(31771692;31671596)

年  份:2017

卷  号:39

期  号:5

起止页码:589-599

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘  要:OSCA是钙通透性阳离子通道蛋白,在高渗胁迫感应中发挥重要的作用。本研究利用生物信息,筛选并鉴定出21个大豆OSCA家族成员。通过染色体定位及同源性分析表明,OSCA家族成员分布在15条染色体上,且存在大量的复制现象;通过Ka/Ks分析表明大豆OSCA家族基因的进化经受纯化选择压力。通过构建系统进化树,将大豆OSCA家族分为2个亚家族,第一亚家族又分为三组(GroupⅠ~Ⅲ),且各组内成员具有相似的内含子-外显子组成模式。保守性分析结果表明,大豆OSCA基因家族很保守,都包含3个功能结构域(即Late exocytosis,Cytosolic domain of 10TM putative phosphate transporter和Calcium-dependent channel);进一步组织表达分析结果表明,OSCA基因家族在不同组织的表达量不同。盐碱胁迫表达模式分析表明,OSCA3.1上调表达变化倍数最大。进一步的启动子分析结果表明,这些盐碱胁迫应答的基因启动子中存在着多种不同的胁迫响应元件,其中干旱和ABA应答相关的元件较多。以上结果为OSCA基因家族提供了新的有价值的信息,并为后续研究提供了重要参考。

关 键 词:大豆 OSCA  家族分析  表达分析  

分 类 号:S565.1]

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