文献类型：期刊文章

作　　者：王远立[1] 啜国晖[2] 闫继芳[2] 石雷[1] 刘琦[2]

机构地区：[1]合肥工业大学计算机与信息学院,安徽合肥230009 [2]同济附属第十人民医院同济大学生命科学与技术学院生物信息学系,上海200092

出　　处：《生物工程学报》

年　　份：2017

卷　　号：33

期　　号：10

起止页码：1744-1756

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2014、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、EBSCO、EMBASE、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：基于CRISPR/Cas9系统的基因编辑已被成功应用于多种细胞类型中。计算机辅助的向导RNA(Guide RNA)设计是使用CRISPR系统成功进行基因编辑的关键步骤之一。目前的计算工作主要致力于利用计算模型来提高sgRNA的打靶效率并降低其脱靶。文中对于目前存在的sgRNA设计工具进行综述,并且说明可以通过建立高效的计算模型,对当前的异质基因编辑数据进行整合挖掘,以获得无偏差的sgRNA设计规则,并预测影响sgRNA设计的关键特征。笔者认为,对于sgRNA打靶和脱靶效果的系统总结和评价,将有助于使用CRISPR系统进行更加精准的基因编辑和基因治疗。

关 键 词：CRISPR 基因编辑  计算机辅助向导RNA设计  脱靶  

分 类 号：Q78]