文献类型：期刊文章

作　　者：梁浩[1] 李敏[1] 董翔宇[1] 李辉[1] 杜志强[1]

机构地区：[1]东北农业大学动物科学技术学院,农业部鸡遗传育种重点实验室,黑龙江省教育厅动物遗传育种与繁殖重点实验室,哈尔滨150030

出　　处：《畜牧兽医学报》

基　　金：国家自然科学基金(31472088);鸡重要经济性状的功能基因组学研究资助(863项目)(2013AA102501)

年　　份：2017

卷　　号：48

期　　号：9

起止页码：1611-1623

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、EMBASE、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：旨在准确获得肉鸡腹脂双向选择系脂肪组织中的RNA编辑位点信息,进而为脂肪相关研究提供更多的信息来源。本研究以东北农业大学肉鸡高、低腹脂双向选择品系第十九世代肉鸡为试验材料,使用转录组测序(RNA-seq)和基因组测序数据识别肉鸡腹部脂肪组织RNA编辑位点。通过生物信息学手段,设定严格的数据过滤与筛选策略,构建RNA编辑位点候选集。结果表明,在候选集中,通过对RNA编辑位点的分类和注释,在低脂系肉鸡脂肪组织中发掘转换型RNA编辑位点28个,颠换型RNA编辑位点101个,插入缺失型RNA编辑位点71个;在高脂系肉鸡脂肪组织中,发掘转换型RNA编辑位点30个,颠换型RNA编辑位点84个,插入缺失型RNA编辑位点77个。绝大多数RNA编辑位点落在内含子、基因间区域及基因上游区域(内含子区41.91%,基因间区域33.08%,基因下游20.59%,基因上游2.94%和外显子区1.47%)。试验验证了4个候选RNA编辑位点,其中3个位点落在与脂肪形成有重要关系的ATP1B3、SLC6A6和FLNB基因区域。本研究鉴定和验证了存在于肉鸡脂肪组织中的RNA编辑位点,为进一步研究RNA编辑影响脂肪组织生长发育的分子机制奠定了基础。

关 键 词：肉鸡 脂肪组织 转换与颠换  插入缺失  RNA编辑

分 类 号：Q344.14] Q752