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期刊文章详细信息

应用IlluminaMiSeq高通量测序技术分析河西走廊地区盐碱土壤微生物多样性    

Microbial diversity in saline alkali soil from Hexi Corridor analyzed by Illumina Mi Seq high-throughput sequencing system

  

文献类型:期刊文章

作  者:牛世全[1] 龙洋[1] 李海云[2] 达文燕[1] 胡山[1] 李渭娟[1] 朱学泰[1] 孔维宝[1]

机构地区:[1]西北师范大学生命科学学院,甘肃兰州730070 [2]甘肃农业大学草业学院,甘肃兰州730070

出  处:《微生物学通报》

基  金:国家自然科学基金项目(No.31260134)~~

年  份:2017

卷  号:44

期  号:9

起止页码:2067-2078

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2014、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘  要:【目的】以甘肃省河西走廊地区的9个盐碱土壤样品(原生盐碱土、次生盐碱土、农田土)为材料,研究该地区盐碱土壤中微生物群落的多样性。【方法】提取土壤微生物总DNA,应用Illumina Mi Seq高通量测序技术进行分析。【结果】从分布在河西走廊3个流域的9个盐碱土样品中共获得325 089条微生物的16S r RNA基因序列。冗余分析和热图分析表明,原生盐碱土与次生盐碱土、原生盐碱土与农田土微生物群落构成差异较大,次生盐碱土与农田土微生物群落差异较小。土壤p H对微生物群落组成的影响最显著。多样性指数和稀释性曲线分析得出,在9个土壤样品中,S6号Shannon指数最大,S1号Shannon指数最小,S1号Simpson指数最大,S6号Simpson指数最小,说明原生盐碱土的微生物群落多样性最低,次生盐碱土的微生物群落多样性最高。盐碱土壤中主要的微生物群落包括9个门,其中变形菌门占主导地位,其余依次是放线菌门、拟杆菌门、酸杆菌门、浮霉菌门、绿弯菌门、芽单胞菌门、厚壁菌门和疣微菌门。原生盐碱土和农田土中占优势的微生物群落是变形菌门,次生盐碱土中占优势的微生物群落是放线菌门。【结论】河西走廊地区盐碱土壤中微生物多样性非常丰富,存在大量的微生物类群,尤其是在次生盐碱土壤中。

关 键 词:ILLUMINA Mi  Seq高通量测序  盐碱土 河西走廊

分 类 号:S154.3]

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