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期刊文章详细信息

全基因组序列的系统发育与重组分析鉴定我国马铃薯Y病毒株系    

Determination of Potato virus Y Strain in China Based on Phylogenetic and Recombination Analyses of the Complete Genomic Sequences

  

文献类型:期刊文章

作  者:蔡伟[1,2] 杨宏凯[2,3] 沈建国[3] 邹文超[2] 高芳銮[2]

机构地区:[1]福清出入境检验检疫局综合技术服务中心,福建福清350300 [2]福建农林大学植物保护学院,福建福州350002 [3]福建出入境检验检疫局检验检疫技术中心,福建福州350001

出  处:《激光生物学报》

基  金:国家重点研发计划项目(2016YFF0203203);福建检验检疫局科技计划项目(FK2015-FQ0001);福清市科技计划项目(FQ201501)

年  份:2017

卷  号:26

期  号:4

起止页码:350-359

语  种:中文

收录情况:CAS、ZGKJHX、普通刊

摘  要:为明确我国马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)株系组成及其在不同寄主上的分布特征,文章对31条PVY中国分离物的基因组编码区进行了系统发育及重组分析。系统发育分析结果显示,最大似然法(maximum likelihood,ML)和邻接法(neighbor-joining,NJ)重建的系统发育拓扑结构基本一致,GF_YL20、FZ10、DF、SD1、1116和9703-3等6个分离物均未与已知株系相聚,其他株系来源相同的分离物以较高的自展值相聚成簇,显示出较强的株系特异性。重组分析显示,31个PVY分离物中,共有28个PVY分离物均检测到具有显著的重组信号,这些分离物主要包括PVY^(N-Wi)、PVY^(NTN)和PVY^(NTN-NW)三种株系。进一步分析显示,分离物1104、DF、SD1、1116和9703-3为未报道过的PVY新重组分离物。株系统计结果显示PVY重组株系已上升为优势株系,生产上需要密切注意这些株系,尤其新重组分离物的发展动态。以上结果表明,综合应用PVY全基因组序列的系统发育和重组分析,可以实现PVY株系的准确鉴定。

关 键 词:马铃薯Y病毒 系统发育分析 重组分析  株系鉴定

分 类 号:S435.32]

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