期刊文章详细信息
苹果小吉丁虫微卫星开发及其种群遗传结构分析
Microsatellite development and genetic diversity analysis of apple buprestid Agrilus mali Matsumura
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]西北农林科技大学植物保护学院,农业部西北黄土高原作物有害生物综合治理重点实验室,陕西杨凌712100 [2]中国林业科学研究院,森林生态环境与保护研究所,北京100091
基 金:国家公益性行业(林业)科研专项(201404403)
年 份:2017
卷 号:44
期 号:4
起止页码:559-566
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:为研究苹果小吉丁虫Agrilus mali Matsumura的种群遗传结构,采用磁珠富集法以生物素标记探针(AC)_(12)和(AG)_(12)构建苹果小吉丁虫微卫星文库,根据阳性克隆测序获得的微卫星侧翼序列设计引物,筛选和开发苹果小吉丁虫多态性微卫星标记,并利用开发的微卫星标记对其不同地理种群的遗传结构进行分析。结果显示,从微卫星文库中的300个阳性克隆中筛选得到248个含有微卫星片段的克隆子,阳性克隆率为82.7%,其中完美型微卫星131个,占52.8%;不完美型90个,占36.3%;混合型27个,占10.9%,表明磁珠富集法开发新微卫星标记的效率较高。从获得的248个苹果小吉丁虫微卫星中筛选获得7个多态性微卫星位点,这7个位点在苹果小吉丁虫8个地理种群样本中的等位基因数为10~23个,有效等位基因数为1.674~12.218个,多态信息含量为0.304~0.796。8个苹果小吉丁虫种群的观测杂合度为0.095~0.676,期望杂合度为0.469~0.755,Shannon指数为0.791~1.621,遗传距离为0.071~0.788。采自新疆维吾尔自治区的7个苹果小吉丁虫种群之间遗传相似度较高,但其与辽宁省种群的遗传相似度较低。
关 键 词:苹果小吉丁虫 微卫星 磁珠 富集文库 遗传结构
分 类 号:S433]
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