文献类型：期刊文章

作　　者：王艳玲[1] 许彦宾[1] 李琼[1] 王盼乔[1] 胡建斌[1] 杨路明[1] 朱华玉[1] 孙守如[1] 马长生[1]

机构地区：[1]河南农业大学园艺学院/河南省果树瓜类生物学重点实验室,郑州450002

出　　处：《农业生物技术学报》

基　　金：国家自然科学基金项目(No.31101544);河南省自然科学基金项目(No.162300410150);河南省教育厅高等学校重点科研项目(No.15A210011)

年　　份：2017

卷　　号：25

期　　号：9

起止页码：1434-1442

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、JST、RCCSE、UPD、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：甜瓜(Cucumis melo)果实外观性状是重要的农艺性状,发掘影响甜瓜果实性状变异的基因(位点)是对果实外观品质进行遗传改良的基础。为此,本研究利用在甜瓜染色体上均匀分布的104个SSR,对甜瓜核心种质进行基因型鉴定,并对2013~2015年连续3年间的5个果实性状进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)。结果表明,在甜瓜核心种质中共检测到456个等位基因,标记的多态性信息含量(polymorphism information content,PIC)为0.12~0.89,平均PIC为0.51。核心种质的遗传多样性较丰富,5个果实性状的多样性指数(Shannon Wiener index,H′)均高于2.0。基于贝叶斯模型可将核心种质分为2个亚群,亚群的划分与甜瓜亚种分类一致。利用GWAS在3个环境下共检测到42个极显著关联位点(P<0.01),4个位点(HNM36、DM0035、HNM38和DM0767)在3年间重复出现,21个位点在2年间重复出现,一些稳定表达的位点与前人连锁分析结果的一致性较高。与果纵径(fruit length,FL)、果横径(fruit diameter,FD)、果形指数(fruit shape index,FS)、果肉厚度(flesh thickness,FT)和单果鲜重(fruit fresh weight,FW)相关位点数分别有10、5、9、8和10个,具有最大表型解释率的位点分别为HNM36、HNM16、CMCCA145、HNM31和HNM31。研究结果为甜瓜果实性状QTL精细定位、候选基因发掘和分子标记开发提供基础。

关 键 词：甜瓜 核心种质 果实性状 全基因组关联分析(GWAS)  

分 类 号：S652]