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登革-2型病毒一步法TaqMan荧光定量RT-PCR检测方法建立
Development and evaluation of TaqMan-based one-step reverse transcriptionpolymerase chain reaction assay for detection of dengue virus type 2
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]贵州医科大学基础医学院现代病原生物学实验室,贵州贵阳550025 [2]贵州医科大学公共卫生学院劳动卫生与环境卫生学教研室 [3]贵州医科大学基础医学院免疫学教研室
基 金:贵州省科技厅基础平台建设项目(黔科平台[2012(4006)]);贵州省社会发展科技公关项目(黔科合SY字[2009]3056)
年 份:2017
卷 号:33
期 号:7
起止页码:1074-1078
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2014、CAS、CSCD、CSCD_E2017_2018、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的建立一种针对登革2型病毒(DENV-2)的快速、灵敏、特异的检测方法。方法从Gen Bank下载105株DENV-2病毒毒株全基因序列,应用生物软件Bioedit进行比对分析筛选出保守序列,在保守区域设计特异引物和探针,建立检测DENV-2的TaqMan荧光定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法。结果该方法检测灵敏度达到102copies/μL;特异性验证中除登革2型病毒有明显扩增外,与墨累谷脑炎病毒、西尼罗病毒、蜱传脑炎病毒、登革病毒1、3、4型、黄热病毒和科萨努尔森林病毒、乙型脑炎病毒均无交叉反应。重复性实验结果表明该方法的组间和组内的变异系数(CV)均<2%。对人工感染DENV-2的87只蚊虫标本进行比对实验,结果荧光定量RT-PCR检测出56份阳性,传统RT-PCR只检测出16份阳性,差异有统计学意义(χ~2=37.908,P=0.000)。结论 TaqMan荧光定量RT-PCR方法检测DENV-2,特异性强、敏感性高。
关 键 词:登革2型病毒(DENV-2) TaqMan荧光定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR) 检测 标准品
分 类 号:R373.3]
参考文献:
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引证文献:
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