文献类型：期刊文章

作　　者：庹玖玲[1] 黄旭斌[2] 杨权[3] 罗洪娇[1] 周凯[1] 张素粉[1] 张甜[1] 曹开源[1] 徐霖[1]

机构地区：[1]中山大学热带病防治研究教育部重点实验室、中山大学香港大学粤港传染病监测联合实验室,广州510080 [2]中山大学附属第一医院呼吸科ICU室,广州510080 [3]广州医科大学基础学院病原生物学与免疫学教研室,广州511436

出　　处：《中华实验和临床病毒学杂志》

基　　金：国家重大传染病防治科技重大项目（2012ZX10004-213）

年　　份：2017

卷　　号：31

期　　号：3

起止页码：212-217

语　　种：中文

收录情况：CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2017_2018、JST、PUBMED、SCOPUS、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：目的 了解2010-2012年广州地区发热呼吸道感染患者的人冠状病毒各亚型分子进化情况.方法 采用RT-PCR法扩增HCoV-OC43、HCoV-229E和HCoV-NL63阳性标本的NP、RdRp和S基因部分片段,构建载体后进行测序,利用Bio-edit、Mega4.0、Clustal1.83等生物信息学软件对测序成功的基因序列进行比对和分析,建立HCoV-OC43、HCoV-229E和HCoV-NL63不同基因区域的分子进化树.结果 2010-2012年期间,HCoV-OC43、HCoV-229E和HCoV-NL63亚型在广州均未检测到重大变异株或重组株.HCoV-OC43与Belgium和中国香港来源流行株亲缘关系较近（GenBank登录号JN129834和AY903460）;HCoV-229E与Amsterdam来源的病毒株亲缘关系最近（GenBank登录号JX503060）;HCoV-NL63与中国北京和Amsterdam来源的流行株亲缘关系较近（GenBank登录号JX104161和DQ445911）.各亚型NP和RDRp为保守基因,S基因变异较大.结论 2010-2012年期间,广州至少存在3种HCoV-OC43、HCoV-229E和HCoV-NL63流行株,没有发现重大变异株或重组株.各亚型NP和RDRp均为保守基因,可用于病毒的检测,S基因变异较大,适用于对分子变异规律的研究.

关 键 词：呼吸道感染 人冠状病毒0C43  人冠状病毒NL63  人冠状病毒229E  分子进化

分 类 号：R440] R511[临床医学类]