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期刊文章详细信息

广西药用野生稻遗传多样性分析及SSR引物数量对遗传多样性结果的影响研究    

Study on Genetic Diversity of Oryza officinalis in Guangxi Province and the Effect of the Number of SSR Primers on Genetic Diversity Analysis

  

文献类型:期刊文章

作  者:苏龙[1,2] 徐志健[2,3] 乔卫华[2] 郑晓明[2] 梁云涛[3] 丁膺宾[1,2] 刘莎[2] 齐兰[2] 公婷婷[2] 梁新霞[2] 王君瑞[2] 张丽芳[2] 程云连[2] 兰进好[1] 杨庆文[2]

机构地区:[1]青岛农业大学农学院,青岛266109 [2]中国农业科学院作物科学研究所,北京100081 [3]广西农业科学院水稻研究所,南宁530007

出  处:《植物遗传资源学报》

基  金:国家自然科学基金(31471471);国家重点研发计划(2016YFD0100101-01-02);农业部财政专项(2016NWB036-01-12);广西壮族自治区主席科技资金项目(1517-03);广西农业科学院基本科研业务专项(2015YT14)

年  份:2017

卷  号:18

期  号:4

起止页码:603-610

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2014、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘  要:采用25对SSR分子标记,对广西境内采集的1610份药用野生稻材料进行遗传多样性和聚类分析,其中检测到等位变异181个,有效等位基因数Ae范围为1.0094(RM240)~2.2674(RM488),平均值为1.3568;期望杂合度He范围为0.0093(RM240)~0.5591(RM448),平均值为0.2112;Shannon多样性指数I在0.0393~0.9296之间变动,平均值为0.3624。数据表明,广西药用野生稻遗传多样性较为丰富,12个药用野生稻地理居群按遗传多样性指数大小排序为:梧州-3>南宁-1>梧州-2>梧州-1>南宁-2>玉林-2>贵港-2>梧州-4>玉林-3>玉林-1>贺州>贵港-1,其中指数高的居群均分布于梧州市和南宁市两地,因此确定了这两地为广西药用野生稻的遗传多样性中心。通过不同数量的SSR引物对药用野生稻材料间相似系数矩阵进行相关性测验,结果显示当引物按照PIC值降序排列时,10对引物即达到较好聚类效果,升序排列时,21对引物即达到较好聚类效果。研究表明,在进行药用野生稻大居群聚类分析时,SSR引物适宜数量应多于21对,最低不得少于10对。

关 键 词:药用野生稻 遗传多样性中心  聚类分析 SSR引物数量  

分 类 号:S511.9]

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同被引文献:

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