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5种方法提取真菌基因组DNA作为PCR模板效果的比较
Effect Comparison of Five Methods to Extract Fungal Genomic DNA as PCR Templates
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]甘肃农业大学植物保护学院,兰州730070
基 金:国家自然科学基金项目"基于形态和分子特征的甘肃省煤污病菌分类和系统发育研究"(No.31300024);甘肃农业大学"伏羲人才计划"项目(No.FXYC20130104)
年 份:2017
卷 号:33
期 号:16
起止页码:28-35
语 种:中文
收录情况:RCCSE、ZGKJHX、普通刊
摘 要:本研究旨在比较CTAB法、改良CTAB法、SDS法、氯化苄法和Chelex-100法提取真菌DNA作为PCR模板的效果,以生长速率、菌落形态差异较大的11个煤污病菌属真菌为研究对象,以核糖体RNA(r RNA)基因中的内转录间隔区(ITS)序列和28S r RNA基因部分序列的扩增率为指标,采用SPSS软件对结果进行方差分析。结果表明,CTAB法和改良CTAB法适用真菌范围最广,分别有7个和9个属真菌的扩增率都大于70%且无显著性差异;氯化苄法和Chelex-100法适用范围居中,分别有6个和8个属真菌的扩增率较高且无显著性差异,扩增率分别大于70%和50%;SDS法适用范围最窄,有6个属真菌的扩增率高于50%且无显著性差异。大多数煤污病菌至少有2种及以上的DNA提取方法能够取得较好的效果,但链丝孢属真菌只有用氯化苄法提取DNA效果最好。采用改良CTAB法结合氯化苄法,能够满足所有供试煤污病菌类群真菌提取基因组DNA用作PCR反应模板的需要。
关 键 词:DNA提取 煤污病菌 CTAB SDS 氯化苄 Chelex-100
分 类 号:S-3]
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