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O26:H11及NM大肠埃希菌CRISPR的分子分布特征及其与stx噬菌体的关系
Association between phage-mediated shiga toxin and molecular distribution of CRISPR in Escherichia coli 026 : H11 or NM
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]郑州大学公共卫生学院流行病与卫生统计学专业,450001 [2]新乡医学院分子诊断与医学检验技术河南省协同创新中心,453003 [3]河南科技大学校医院,洛阳471023 [4]预防医学教研室
年 份:2017
卷 号:38
期 号:7
起止页码:944-949
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2014、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、EMBASE、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的探讨026:H11及NM血清型大肠埃希菌中成簇规律间隔短回文重复序列(CRISPR)的分子分布特征及其与stx噬菌体的关系。方法135株026:H11及NM血清型大肠埃希菌从NCBI数据库获取,利用CRT软件及CRISPRFinder提取CRISPR信息,并用Excel软件对间隔序列进行编号及分析CRISPR亚型,并分析CRISPR与stx噬菌体之间的关系。结果135株026:H11及NM血清型大肠埃希菌中均存在CRISPR结构,CRISPRl包括19个亚型,CRISPR2.1包括22个亚型,CRISPR2.2包括1个亚型,CRISPR3—4包括1个亚型。stx噬菌体在CRISPR群组C中出现,stx^+菌株比stx^+菌株拥有更多的间隔序列。结论CRISPR位点在026:H11或NM血清型大肠埃希菌中广泛存在,且存在着不同的亚型,stx噬菌体与CRISPR的分子分布特征有关,可能作为鉴定高毒菌株的分子靶标。
关 键 词:大肠埃希菌 成簇规律间隔短回文重复序列 stx噬菌体
分 类 号:R446.5]
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