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铜绿假单胞菌PA0861突变菌株表达谱检测分析
Analysis of the gene expression profile to reveal biological functions of the gene PA0861 from the PAO1 strain of Pseudomonas aeruginosa
文献类型:期刊文章
LI Jiu-long GUO Jia-yi ZHANG Yan CHENG YI-fan MAN Geng-xiao HUANG Wei-dong(Basic Medical College, Ningxia Medical University, Yinchuan 750004, China Medical Science and Technolo- gy Research Center, Ningxia Medical University)
机构地区:[1]宁夏医科大学基础医学院,宁夏银川750004 [2]宁夏医科大学医学科学技术研究中心
基 金:国家自然科学基金项目(No.81260243)
年 份:2017
卷 号:12
期 号:6
起止页码:495-499
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2014、CAB、CSCD、CSCD_E2017_2018、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的分析铜绿假单胞菌野生型菌株PAO1及PA0861突变菌株基因表达谱,探讨铜绿假单胞菌中GGDEFEAL基因PA0861的生物学功能。方法以野生型铜绿假单胞菌PAO1及PA0861基因转座子插入失活的突变体菌株为材料,利用结晶紫染色方法进行细菌生物膜的表型分析;利用Microarray技术分析其基因表达谱的变化;采用半定量RT-PCR验证Microarray结果。结果 PA0861突变株生物膜的合成量在4、8、12h均高于PAO1(P<0.05),在12h时增加了近1倍;利用Microarray技术筛选出差异表达基因517个,其中319个上调,198个下调。生物分子功能注释和Pathway分类显示这些差异表达基因除涉及代谢过程中基本的物质变化和能量转换外,突变体PA0861中涉及铁载体生物合成基因的表达增高。半定量RT-PCR验结果一致。结论铜绿假单胞菌突株PA0861基因表达谱发生改变,其中铁载体生物合成基因高表达,提示c-di-GMP可能通过对铁载体的调控影响细菌生物膜的形成。
关 键 词:铜绿假单胞菌 C-DI-GMP MICROARRAY 生物膜 铁载体
分 类 号:R378.99]
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