期刊文章详细信息
2016年杭州地区肠道病毒71型VP1基因序列测定及进化分析
Sequencing and evolution analysis of enterovirus 71 VP1 gene in Hangzhou in 2016
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]杭州电子科技大学校医院检验科,浙江杭州310018 [2]杭州电子科技大学生仪学院,浙江杭州310018 [3]杭州市儿童医院检验科,浙江杭州310014 [4]浙江大学基础医学院,浙江杭州310058
基 金:2015年浙江省教育厅科研项目(Y201533677)
年 份:2017
卷 号:27
期 号:12
起止页码:1787-1789
语 种:中文
收录情况:CAS、ZGKJHX、普通刊
摘 要:目的通过测定和分析肠道病毒71型毒株VP1区序列,掌握了EV71的流行情况及种系进化关系,为手足口病毒所致疾病的预防和治疗提供支持和依据。方法利用RT-PCR的方法扩增EV71病毒VP1区核苷酸序列,测序后利用DNASTAR和Primer Premier 5.0进行序列比对分析,并用Mega 3.1软件建立检测样本VP1区序列与Gen Bank上EV71基因型参考毒株基因序列的系统发育树。结果随机选取的21株EV71分离株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为95.6%~100%和99.2%~100%;通过系统进化树分析显示,21株EV71均属于C4a基因亚型。结论 2016年杭州地区EV71毒株的基因亚型与当前国内外某些地区的分型结果一致,故它们有望成为疫苗候选株并作进一步研究。
关 键 词:手足口病 肠道病毒71型 VP1 系统进化分析
分 类 号:R725.1]
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