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期刊文章详细信息

一株烟草青枯雷尔氏菌烈性噬菌体RS-PⅡ-1的分离及全基因组分析    

Isolation and Whole Genome Sequencing of a Novel Lytic Bacteriophage RS-PⅡ-1 Infecting Ralstonia Solanacearum

  

文献类型:期刊文章

作  者:苏靖芳[1,2] 刘俊杰[2] 于浩[1,2] 郭兆奎[3] 孙宏伟[3] 范国权[4] 顾刚[5] 王光华[2]

机构地区:[1]黑龙江八一农垦大学农学院,大庆163319 [2]中国科学院黑土区农业生态重点实验室,中国科学院东北地理与农业生态研究所,黑龙江哈尔滨150081 [3]中国烟草总公司黑龙江省公司牡丹江烟草科学研究所,牡丹江157011 [4]黑龙江省农业科学院植物脱毒苗木研究所,哈尔滨150086 [5]福建省烟草专卖局烟草农业科学研究所,福州350003

出  处:《病毒学报》

基  金:中国烟草总公司科技重点项目(项目号:110201402014)

年  份:2017

卷  号:33

期  号:3

起止页码:441-449

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:分离鉴定一株侵染烟草青枯雷尔氏菌的烈性噬菌体,观察其形态特征,并进行全基因组测序与分析,为采用噬菌体疗法防治烟草青枯病提供技术储备。以烟草青枯菌TB15-15为宿主菌,从土壤中筛选分离得到噬菌体;分离得到的噬菌体经纯化浓缩,采用透射电子显微镜观察其形态特征;提取噬菌体DNA,进行全基因组高通量测序,分析其全基因组的结构特征,比较基因组分析明确其进化关系。以TB15-15为宿主菌,从长期种植烟田土壤中分离得到一株青枯雷尔氏菌烈性噬菌体。电镜观察显示,该噬菌体属于有尾噬菌体目、短尾噬菌体科。基因组全长42 042bp,GC含量为63.2%,含有46个开放阅读框,比较基因组分析确定该噬菌体为一株新的青枯雷尔氏菌烈性噬菌体,命名为RS-PⅡ-1。以烟草青枯菌为宿主菌,分离到一株新的青枯雷尔氏菌烈性噬菌体RS-PⅡ-1,明确了其形态和基因组特征,为防治青枯病的噬菌体疗法奠定基础。

关 键 词:烟草 青枯雷尔氏菌 烈性噬菌体  全基因组测序 全基因组分析

分 类 号:S432.1]

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