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2013~2016年东部沿海地区甲型H1N1流感病毒分子特征分析
Molecular characteristics analysis of influenza A(H1N1) pdm09 virus in the eastern foreland during 2013-2016
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]杭州市肿瘤医院杭州市第一人民医院吴山院区检验科,杭州310002 [2]江苏大学医学院检验医学系,江苏镇江212013 [3]浙江大学医学院附属第一医院检验科浙江省临床体外诊断技术重点实验室,杭州310003
基 金:浙江省医药卫生科技项目(2015KYB149);浙江省自然科学基金(LY16H200001);浙江省教育厅项目(Y201534117)
年 份:2017
卷 号:35
期 号:4
起止页码:306-309
语 种:中文
收录情况:CAS、CSCD、CSCD_E2017_2018、JST、ZGKJHX、普通刊
摘 要:目的通过分析东部沿海地区(江苏、浙江和上海)甲型H1N1流感病毒[A(H1N1)pdm09]的分子特征,为防控A(H1N1)pdm09流感提供科学依据。方法从GISAID数据库中获得江浙沪地区2013~2016年分离的A(H1N1)pdm09病毒株和WHO推荐疫苗株的血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因序列。运用MEGA6.0软件分析HA和NA的分子特征、关键氨基酸位点和耐药位点的变异情况。结果进化树分析显示江浙沪地区A(H1N1)pdm09病毒株与WHO参考株的HA、NA基因序列差异较小,与WHO推荐疫苗株A/California/07/2009(H1N1)间的同源性分别为97.0%~99.5%和97.9%~99.6%;与WHO推荐疫苗株A/South_Africa/3626/2013(H1N1)间的同源性分别为98.0%~99.8%和98.6%~99.9%。病毒氨基酸变异分析显示70株A(H1N1)pdm09病毒的HA蛋白均发生83位(P83S)、203位(S203T)和321位(I321V)突变,且2016年分离株出现A195V突变;HA的裂解位点未发生变异,仍为IQSR↓GLF;2013年有2株NA蛋白出现H275Y耐药位点的变异。结论 2013~2016年东部沿海地区A(H1N1)pdm09流感病毒的HA和NA蛋白与WHO推荐疫苗株具有高度同源性,关键的氨基酸位点发生变异与病毒的毒力及对药物的敏感性相关,因此我们要密切关注A(H1N1)pdm09病毒,防止其再次发生暴发。
关 键 词:甲型H1N1流感病毒 分子特征 进化树 变异
分 类 号:R512.5]
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