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大黑毛肩长蝽(半翅目:异翅亚目:地长蝽科)线粒体基因组及地长蝽科系统发育地位探讨
The complete mitochondrial genome of Neolethaeus assamensis(Hemiptera:Heteroptera:Rhyparochromidae) and the implication for the phylogenetic position of Rhyparochromidae in Lygaeoidea
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]南开大学生命科学学院,天津300071 [2]兰州大学生命科学学院,兰州730000 [3]内蒙古大学生命科学学院,呼和浩特010021 [4]生物多样性演化与保护广东普通高校重点实验室,中山大学生物博物馆,中山大学生命科学学院,广州510275
基 金:国家自然科学基金(31572242)
年 份:2017
卷 号:39
期 号:2
起止页码:314-331
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2014、CSCD、CSCD_E2017_2018、JST、PROQUEST、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:为了更加深入地了解地长蝽科的基因组水平特征,测序并分析了大黑毛肩长蝽Neolethaeus assamensis(半翅目:异翅亚目:地长蝽科:毛肩族)的线粒体基因组序列。大黑毛肩长蝽线粒体基因组是双链共价环状DNA分子,长度为17097 bp,编码13个蛋白质编码基因,22个t RNA基因和2个r RNA基因,基因排列方式同果蝇Drosophila yakuba一致。大黑毛肩长蝽线粒体基因组内存在2个大的非编码区。一个是控制区,另一个是位于ND6和Cyt B之间的串联重复区域,TRR4.4。控制区内包含7类共9个结构显著的区域,如一个茎环结构,3个非串联的重复序列以及其他5个结构区域。TRR4.4长802 bp,包括4个184 bp的重复单元和1个66 bp的部分重复单元。TRR4.4的重复单元与控制区中TRR2.7的重复单元在长度、方向以及核苷酸组成等方面几乎完全一致。22个t RNA全部能够折叠为典型的三叶草二级结构。16S r RNA二级结构包含6个结构域(结构域III在节肢动物中缺失)和44个茎环结构,12S r RNA二级结构包含3个结构域和28个茎环结构。基于蝽次目15个线粒体基因组数据分析得到的系统发育结果,支持地长蝽科位于长蝽总科基部分支的观点。
关 键 词:线粒体基因组 大黑毛肩长蝽 串联重复序列 重组 系统发育
分 类 号:Q963] Q961
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