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长春花生物碱合成途径相关基因表达丰度与MeJA处理后基因表达差异分析
Analysis of Transcript Abundance and Expressing Difference of Genes in C.roseus TIAs Biosynthesis by MeJA Treatment
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]西南大学生命科学学院,重庆400715 [2]西南大学-西藏农牧学院药用植物联合研发中心,重庆400715 [3]重庆科技学院,重庆401331
基 金:国家级大学生创新创业训练计划项目(201510635011);国家863计划(2011AA100605);新世纪优秀人才支持计划(NCET-12-0930)项目基金共同资助
年 份:2017
卷 号:36
期 号:3
起止页码:1009-1020
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、JST、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:长春花(Catharanthus roseus)中含有丰富的次生代谢产物,可产生130多种萜类吲哚生物碱,包括目前临床应用最广的天然植物抗癌药物长春碱(vinblastine)和长春新碱(vincristine)。长春花萜类吲哚生物碱(terpenoid indole alkaloids,TIAs)合成途径包括在内韧皮部相关薄壁细胞、上皮细胞、异细胞和乳管细胞等多种组织细胞内进行的20多步酶促反应。本研究选取TIAs途径上的CPR、LAMT、SLS、STR、SGD、TDC、16-OMT、T16H、D4H等9个酶基因,基于长春花转录组数据库,分析其在各组织器官和MeJA处理下的无菌苗、毛状根和悬浮细胞中的数字表达谱,找出其中可能对MeJA信号响应的基因。本研究发现,MeJA处理后,长春花无菌苗中以上9个基因表达量均发生上调;毛状根中除了TDC,另外8个基因表达丰度均为上调;悬浮细胞中除了D4H,另外8个基因表达丰度均上调。对整个转录组数据进行分析,发现经过MeJA处理后,仅有673条Unigene能在无菌苗、毛状根和悬浮细胞中均表现出差异表达,说明无菌苗、毛状根和悬浮细胞的MeJA应答机制存在较大不同。对这些能在3种体系中均发生差异表达的基因进行功能分类,主要包括初生代谢相关蛋白、次生代谢相关蛋白、植物激素相关蛋白、矿质离子结合蛋白、转运蛋白、信号转导相关蛋白、细胞壁合成与降解相关蛋白、转录因子、植物逆境响应蛋白9个方面。本研究可为通过外源因子调控长春花生物碱的生物合成提供参考。
关 键 词:长春花萜类吲哚生物碱 合成途径 数字表达谱 MeJA处理 差异表达基因
分 类 号:Q943.2[植物生产类]
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