文献类型：期刊文章

作　　者：张少平[1,2] 邱珊莲[1] 郑云云[1,2] 张帅[1] 吴松海[1] 何炎森[1] 郑开斌[1,2]

机构地区：[1]福建省农业科学院亚热带农业研究所,福建漳州363005 [2]福建省农业科学院作物研究所,福建福州350013

出　　处：《核农学报》

基　　金：福建省公益类科研院所专项(2016R1012-4);福建省农业科学院青年英才计划项目(YC2015-19);福建省农业科学院科技创新团队PI项目(2016PI-2)

年　　份：2017

卷　　号：31

期　　号：4

起止页码：643-653

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2014、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：黄秋葵为药食兼用型植物,富含花青素、多糖、黄酮及萜类等活性成分。为探讨黄秋葵次级代谢过程中这些活性物质合成的遗传基础,以紫色黄秋葵嫩茎叶为材料,采用Illumina Hi Seq 2500高通量转录组测序技术获得23 026 500个短读序,经组装获得42 484个Unigene,平均长度877 bp。31 931个和21 926个Unigene分别在Nr和Swiss Prot数据库有同源比对信息;Unigene与COG、KOG数据库进行比对,根据其功能各分为24类和25类;通过Pfam数据库,所注释到的20 031个Unigene分属于7 277类蛋白结构域;GO注释到18 602个Unigene分为细胞组分、分子功能及生物学过程等三大类的51个功能组,其中大量Unigene与细胞部分、细胞、催化活性、结合活性、代谢进程及细胞进程相关;根据KEGG数据库,可将7 619个Unigene定位到119个代谢途径分支,其中有1、3、35、61、13和70个Unigene分属于花色素苷、黄酮、类黄酮、N-多糖、二萜类和萜类骨架生物合成路径,它们可能参与这些活性物质的生物合成。本研究结果为后续深入开展黄秋葵花青素、黄酮类等物质代谢合成途径及相关功能基因研究奠定了基础。

关 键 词：紫色黄秋葵  转录组基因  测序分析 功能注释

分 类 号：S649]