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期刊文章详细信息

高温胁迫下茄子qRT-PCR内参基因筛选及稳定性分析    

Selection and Stability Analysis of Reference Gene for qRT-PCR in Eggplant Under High Temperature Stress

  

文献类型:期刊文章

作  者:庞强强[1,2,3] 李植良[1] 罗少波[1] 陈日远[2] 金庆敏[1] 黎振兴[1] 李德明[3] 孙保娟[1] 孙光闻[2]

机构地区:[1]广东省农业科学院蔬菜研究所,广州510640 [2]华南农业大学园艺学院,广州510642 [3]海南省农业科学院蔬菜研究所,海口570100

出  处:《园艺学报》

基  金:国家自然科学基金项目(31501755);广东省自然科学基金项目(2015A030313568);广东省科技计划项目(2016B070701010);广州市科技计划项目(2014J4100094;201510010075)

年  份:2017

卷  号:44

期  号:3

起止页码:475-486

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:为筛选茄子(Solanum melongena L.)高温胁迫下稳定表达的内参基因,以不同茄子品系(种)为研究对象,利用实时荧光定量PCR技术对来自茄子高温胁迫转录组数据库8个候选内参基因(SmEF1a、SmEF2、Sm40s RPS29、Sm60s RPL24、SmTRX、SmCK I、SmDAHPS I、SmUCP)和SmActin在不同试验情况下进行表达检测,并结合GeNorm、Norm Finder、Best Keeper和ReFinder软件综合评价9个内参基因的表达稳定性。结果表明,在茄子热敏品系05-1和耐热品系05-4经高温处理不同时间的样品和不同组织样品以及10个耐热性不同的茄子品系(种)中,9个内参基因的表达丰度及稳定性存在差异;茄子热敏品系05-1和耐热品系05-4高温胁迫处理不同时间样品中表达稳定性最好的是SmEF1a和SmUCP;其不同组织中表达水平最稳定的是SmEF1a和SmTRX;高温胁迫下不同茄子品系(种)中以SmTRX和SmEF2的表达稳定性最好。综合来看,SmEF1a和SmTRX在所有茄子试验样品中的表达稳定性最好,而SmActin和SmCK I的表达稳定性较差。

关 键 词:茄子 高温胁迫 内参基因 表达稳定性  实时荧光定量PCR  

分 类 号:S641.1]

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