文献类型：期刊文章

作　　者：刘湘宁[1,2] 戴良英[1,2] 李魏[1,2] 董铮[1,2] 唐前君[1,3,2]

机构地区：[1]湖南农业大学植物保护学院,长沙410128 [2]湖南省植物病虫害生物学与防控重点实验室,长沙410128 [3]湖南农业大学病毒研究所,长沙410128

出　　处：《植物保护》

基　　金：公益性行业(农业)科研专项(201303028);国家自然科学基金(31101413);湖南省烟草公司科技计划项目(13-14ZDAa04;14-16ZDAa02)

年　　份：2017

卷　　号：43

期　　号：2

起止页码：88-94

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：采自湖南地区的辣椒轻斑驳病毒Pepper mild mottle virus(PMMoV)样品经单斑分离后,根据已经报道的PMMoV序列基因保守区设计6对简并引物,采用片段重叠法和RACE方法扩增、克隆获得一个全长为6 356bp的湖南分离物(PMMoV-HN1,登录号:KP345899)全基因组序列,编码4个蛋白,分别为126kD蛋白(70~3 423nt)、183kD蛋白(70~4 908nt)、28kD蛋白(4 909~5 682nt)和17.5kD蛋白(5 685~6 158nt),5′-非编码区(5′-UTR)和3′-非编码区(3′-UTR)分别含有69和198个碱基,其中5′-UTR存在一个序列为m7G5′pppG的甲基化核苷酸帽子结构。一致性分析发现PMMoV-HN1与PMMoV其他分离物的核酸一致性为94%~99%,编码的氨基酸一致性为94%~99%。全基因组序列系统进化分析表明PMMoV-HN1分离物与中国首次报道的PMMoV-CN分离物亲缘关系最近。本研究是国内报道的第二例PMMoV全基因组序列。

关 键 词：辣椒 辣椒轻斑驳病毒 全基因序列 序列分析  

分 类 号：S432.41]